Table 1.

Sequences of primers and dually labeled fluorescent probes

Target	Primer or probe	Primer or probe sequence (5′ → 3′)	Probe fluorophore/quencher	Amplicon size (bp)
N. gonorrhoeae genomic	Forward primer	ACCCGATATAATCCGTCCTTCA	5′-TEX615/3′-IAbRQSp	72
	Reverse primer	TTCGGCTCCTTATTCGGTTTAAC
	Probe	CGTCCTTCAACATCAGTGAAAATCG
C. trachomatis genomic	Forward primer	ATTTGCCGCTTTGAGTTCTGCTTCCT	5′-TYE665/3′-IAbRQSp	75
	Reverse primer	ATCATAAGGCTTGGTTCAGCAGGATTC
	Probe	CCTCCTTGCAAGCTCTGCCTGTGGGG
C. trachomatis plasmid	Forward primer	AGGCGATTTAAAAACCAAGGTCGATGT	5′-TYE665/3′-IAbRQSp	89
	Reverse primer	GAAGAATTGATCCAACACCCTTATCG
	Probe	CCGTATGTGAATGTCGAACTCATCCG