Table 1.
16S rRNA analysis (GenBank) | 16S rRNA analysis (MicroSeq) | 16S rRNA analysis (EzTaxon) | 16S rRNA analysis (BIBI) | tuf gene analysis (GenBank) | tuf gene analysis (BIBI) | Vitek 2 | MicroScan | Definitive ID | No. of isolates |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis (100.0 [12], 99.7 [8], 99.4 [6], 99.1 [3], 98.8 [1]) | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | 30 |
S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis (100.0 [1], 99.7 [1], 99.4 [1]) | S. epidermidis | S. hominis | S. epidermidis | S. epidermidis | 3 |
S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis (99.1) | S. epidermidis | S. epidermidis | S. aureus | S. epidermidis | 1 |
S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. hominis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | 1 |
S. epidermidis/S. capitis/ S. caprae (99.9) | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | 1 |
S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. caprae/ S. capitis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | S. epidermidis | 1 |
Where the percentage of identity for 16S rRNA analysis with GenBank, MicroSeq, or EzTaxon or for tuf analysis with GenBank is not 100%, the percentage of identity is given in parentheses, and the number of isolates with that percentage of identity (if more than 1) is given in brackets.