Table 3.
16S rRNA analysis (GenBank) | 16S rRNA analysis (MicroSeq) | 16S rRNA analysis (EzTaxon) | 16S rRNA analysis (BIBI) | tuf gene analysis (GenBank) | tuf gene analysis (BIBI) | Vitek 2 | MicroScan | Definitive ID | No. of isolates |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
S. auricularis/ S. haemolyticus/ S. warneri | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus (99.7 [1], 99.6 [1], 99.1 [1]) | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | 4 |
S. auricularis/ S. haemolyticus/ S. warneri | S. haemolyticus | S. haemolyticus (99.8) | S. capitis/S. caprae | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | 1 |
S. auricularis/ S. haemolyticus/ S. warneri | S. haemolyticus | S. haemolyticus (99.7) | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. epidermidis | S. epidermidis | S. haemolyticus | 1 |
S. auricularis/ S. haemolyticus/ S. warneri | S. haemolyticus | S. haemolyticus (99.7) | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. haemolyticus | S. simulans | S. haemolyticus | 1 |
S. hominis/S. warneri/ S. hyicus (100.0 [7], 99.8 [2]) | S. hominis (100.0 [3], 99.9 [1], 99.8 [5]) | S. hominis (100.0 [3], 99.8[6]) | S. hominis | S.hominis (100.0 [2], 99.7 [2], 99.6 [1], 99.4 [1], 99.3 [1], 98.6 [1], 98.3 [1]) | S. hominis | S. hominis | S. hominis | S. hominis | 9 |
S. hominis | S .hominis (99.9 [1], 99.8 [1], 99.7 [4]) | S. hominis (99.8 [6]) | S. xylosus | S. hominis (99.4 [1], 99.1 [2], 98.9 [1], 98.8 [1], 98.0 [1]) | S. hominis | S. hominis | S. aureus | S. hominis | 6 |
S. hominis/S. warneri/S. hyicus (100.0 [2], 99.8 [1]) | S. hominis (99.8 [3]) | S. hominis (100.0 [1], 99.8 [2]) | S. xylosus | S. hominis (100.0 [2], 99.1 [1]) | S. hominis | S. hominis | S. hominis | S. hominis | 3 |
S. hominis/S. warneri/S. hyicus (99.8) | S. hominis | S. hominis | S. hominis | S. hominis | S. hominis | NAb | S. hominis | S. hominis | 1 |
S. hominis/S. warneri/S. hyicus | S. hominis (99.8) | S. hominis (99.8) | S. xylosus | S. hominis (99.1) | S. hominis | Kocuria variant | S. hominis | S. hominis | 1 |
S. hominis/S. warneri/S. hyicus | S. hominis (99.7) | S. hominis/S. haemolyticus (99.8) | S. xylosus | S. hominis | S. hominis | S. hominis | S. hominis | S. hominis | 1 |
S. hominis/S. warneri/S. hyicus | S. hominis (99.7) | S. hominis (99.8) | S. hominis | S. hominis (99.1) | S. hominis | S. hominis | S. epidermidis | S. hominis | 1 |
Where the percentage of identity for 16S rRNA analysis with GenBank, MicroSeq, or EzTaxon or for tuf analysis with GenBank is not 100%, the percentage of identity is given in parentheses, and the number of isolates with that percentage of identity (if more than 1) is given in brackets.
NA, not available.