Table 3.
SS | EGF-1 | EGF-2 | EGF-3 | EGF-4 | THR | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Country | 2 | 35 | 38 | 87 | 97 | 130 | 131 | 132 | 137 | 138 | 149 | 170 | 174 | 183 | 196 | 198 | 199 | Ref. |
Sal-I | N | L | M | Q | E | I | Q | S | C | A | K | C | E | E | S | S | V | AAC99769 |
Iran | • | • | • | Q/K | E/Q | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [24] |
Mexico | • | • | • | Q/K | • | I/T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [31] |
Brazil | • | • | • | K | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [23] |
Colombia | • | • | • | K | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [23] |
Venezuela | • | • | T | K | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [23] |
Mauritania | • | • | • | K | • | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [23] |
Turkey | • | • | • | K | • | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | ABG29073 |
PNG | • | • | • | • | • | T | K | R | • | • | N | • | • | • | • | • | • | [23] |
Nicaragua | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | R | • | • | • | • | • | [23] |
India | • | • | • | • | Q | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [25] |
India | • | • | • | • | E/Q | T | Q/K | • | C/W | A/G | • | • | E/K | E/K | S/F | S/T | V/E | [26] |
Bangladesh | • | • | • | • | E/Q | T | Q/K | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [25] |
Vietnam | • | • | • | • | • | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | ABG29072 |
Indonesia | • | • | • | • | Q | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [23] |
Thailand | • | • | • | • | E/Q | T | Q/K | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [15] |
N Korea | • | • | • | • | • | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [23] |
S Korea | N/D | • | • | • | E/Q | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [22] |
China (ZJ/HB) | • | • | • | • | E/Q | T | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | [32] |
China (YN) | • | L/M | • | • | E/Q | T | Q/K | • | • | • | • | • | • | • | • | • | • | This study |
SS, secretary signal sequence; EGF, EGF-like domain; THR, the C terminal hydrophobic region. Ref: references. ZJ/HB and YN represented isolates from Zhejiang/Hubei and Yunnan Provinces in China, respectively. • indicates identical amino acid residues compared to the Salvador I strain.