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. 2011 Dec;179(6):2920–2930. doi: 10.1016/j.ajpath.2011.08.022

Table 1.

Primers Used in RT-PCR

Gene Forward primer Reverse primer
Semi-quantitative RT-PCR
 ACVRL1 5′-CTCTACGACTTTCTGCAGAG-3′ 5′-CCACTTGTAGGACTCAAAGC-3′
 ACVR1 5′-ATGTCTTTTAGCCTGCCTGCTG-3′ 5′-ATCAAGCTGATTGGTGCTCTGG-3′
 BMPR1A 5′-TGATTTGGAACAGGATGAAGC-3′ 5′-TGTAGCACATTTCAGGAAGTC-3′
 TGFBR1 5′-TCGCCCTTTTATTTCAGAGGGTACT-3′ 5′-ACAGCAAGTTCCATTCTTCTTTACC-3′
 BMPR1B 5′-GCAGCACAGACGGATATTGT-3′ 5′-TTTCATGCCTCATCAACACT-3′
 ACVR2A 5′-GCAAAATGAATACGAAGTCTA-3′ 5′-GCACCCTCTAATACCTCTGGA-3′
 ACVR2B 5′-ACACGGGAGTGCATCTACTACAACG-3′ 5′-TCATGAGCTGGGCCTTCCAGA-3′
 BMPR2 5′-CTGCACAGTGTGCTGAGGAAAG-3′ 5′-TGAACTGCCCTGTTACTGCCA-3′
 TGFBR2 5′-ATAAGGCCAAGCTGAAGCAG-3′ 5′-CTTCTGGAGCCATGTATCTTG-3′
 SMAD1 5′-TGCCACTCAACGCCACTTTT-3′ 5′-TCATAAGCAACCGCCTGAACAT-3′
 SMAD2 5′-CCCATCGAAAAGGATTGCCACA-3′ 5′-TGCATGGAAGGTTTCTCCAACC-3′
 SMAD3 5′-GGACGACTACAGCCATTCCA-3′ 5′-TTCCGATGTGTCTCCGTGTCA-3′
 SMAD4 5′-CTTTGAAATGGATGTTCAG-3′ 5′-CATCCTGATAAGGTTAAGGG-3′
 SMAD5 5′-ACGTCAATGGCCAGCTTGTT-3′ 5′-TCCAACGGCTTTAGCTCATGA-3′
 SMAD8 5′-ATCTTTGTGCAGAGCCGGAA-3′ 5′-TCCTGGCGATGATACTCAGCA-3′
 BMP2 5′-CCAGAAACGAGTGGGAAAAC-3′ 5′-AAGTCCACGTACAAAGGGTG-3′
 BMP4 5′-ACTGGTCCACCACAATGTGACACG-3′ 5′-GCTGAAGTCCACATAGAGCGAGTG-3′
 ACTB 5′-TCACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3′ 5′-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3′
Quantitative real-time RT-PCR
 ID3 5′-GACTTCACCAAATCCCTTCC-3′ 5′-CCACTCCTTCCACACCTC-3′
 CDKN1A 5′-AGTGGACAGCGAGCAGCTGA-3′ 5′-CGAAGTTCCATCGCTCACGG-3′
 CDKN1B 5′-CGGTGGACCACGAAGAGTTAA-3′ 5′-GGCTCGCCTCTTCCATGTC-3′
 CDKN2A 5′-TGCCTTTTCACTGTGTTGGAGTT-3′ 5′-TCGCAAGAAATGCCCACAT-3′
 CDKN2B 5′-CCGCCCACAACGACTTTATT-3′ 5′-CAGCCTTCATCGAATTAGGTG-3′
 CDC25A 5′-GCCTGTCACCAACCTGAC-3′ 5′-CCAGGAGAATCTAGACAGAAACC-3′
 MYC 5′-CCACACATCAGCACAACTACGC-3′ 5′-CGGTTGTTGCTGATCTGTCTCA-3′
 SMAD4 5′-GATACGTGGACCCTTCTGGA-3′ 5′-ACCTTTGCCTATGTGCAACC-3′
 ACTB 5′-TCACCCACACTGTGCCCATCTACGA-3′ 5′-CAGCGGAACCGCTCATTGCCAATGG-3′