Table 3. Associations between haplotype frequencies of the six SNPs in HPSE and clinicopathological parameters (n = 404).

	Block1				Block2
	GC	AG	AC	overall	CA	TG	CG	overall
Borrmann type
Borr1+2	0.822	0.154	0.023		0.769	0.125	0.106
Borr3+4	0.853	0.122	0.025		0.834	0.099	0.067
P*	0.445	0.377	0.895	0.673	0.037 #	0.29	0.076	0.095
Histologic grade
Well	0.839	0.122	0.039		0.800	0.116	0.084
Poor	0.846	0.134	0.020		0.822	0.103	0.075
P*	0.579	0.975	0.144	0.343	0.430	0.544	0.659	0.731
pT category
T1	0.789	0.175	0.035		0.763	0.136	0.102
T2	0.873	0.112	0.015		0.807	0.121	0.071
T3	0.841	0.126	0.033		0.824	0.097	0.079
T4	0.864	0.130	0.006		0.848	0.091	0.061
P*	0.363	0.575	0.344	0.539	0.069	0.160	0.329	0.189
pN category
N0	0.795	0.176	0.029		0.808	0.096	0.096
N1	0.894	0.074	0.032		0.796	0.092	0.112
N2	0.855	0.122	0.023		0.809	0.118	0.073
N3	0.864	0.117	0.019		0.835	0.114	0.051
P*	0.108	0.158	0.444	0.272	0.445	0.427	0.045 #	0.114
Venous invasion
Negative	0.845	0.131	0.025		0.815	0.107	0.078
Positive	0.833	0.167	0.000		1.00	0.000	0.000
P*	0.464	0.340	0.674	0.586	0.181	0.327	0.423	0.409
Lymphovascular invasion
Negative	0.826	0.141	0.026		0.821	0.096	0.076
Positive	0.879	0.101	0.020		0.785	0.135	0.080
P*	0.090	0.101	0.663	0.232	0.187	0.125	0.872	0.293
TNM stage
I	0.829	0.146	0.024		0.806	0.100	0.094
II	0.822	0.139	0.038		0.792	0.108	0.099
III	0.862	0.121	0.017		0.833	0.107	0.059
P*	0.267	0.443	0.320	0.451	0.259	0.873	0.076	0.207

*Two-sided χ² test, each haplotype compared with all other haplotypes.

^#Statistically significant (P<0.05).