Table 3.
Drug-resistant HCV mutant detection by MAMA PCR and standard cloning and sequencing methods
| Patient no. and detection method | Mutation |
|||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| V36 |
T54 (A) | V55 (A) | R155 |
A156 |
V170 (A) | |||||
| A | M | K | S | T | T | V | ||||
| 1 | ||||||||||
| MAMA PCR | + | − | − | − | − | + | − | − | + | − |
| Consensus sequencing | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EPLD | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Bacterial cloning | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 2 | ||||||||||
| MAMA PCR | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − |
| Consensus sequencing | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EPLD | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Bacterial cloning | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 3 | ||||||||||
| MAMA PCR | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Consensus sequencing | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EPLD | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Bacterial cloning | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| 4 | ||||||||||
| MAMA PCR | + | − | + | − | − | − | − | + | − | − |
| Consensus sequencing | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| EPLD | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
| Bacterial cloning | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |