Table 3.
Data on S. iniae and L. garvieae strains analyzed in phylogenic analysis.
| Country | Bacterial species | Accession number | Source (year) | Target gene |
|---|---|---|---|---|
| Argentina | L. garvieae TW34 (1398bp) | GQ845022 | Odontesthes platensis (2010) | 16S rRNA |
| Australia | S. iniae QMA0078 (1180 bp) | EU086698 | Lates calcarifer (2007) | LctO |
| S. iniae QMA0076 (1228bp) | EU086697 | L. calcarifer (2007) | LctO | |
| S. iniae QMA00126 (1279bp) | EU086699 | L. calcarifer (2007 | LctO | |
| S. iniae QMA00140 (1228bp) | EUO86700 | L. calcarifer (2007) | LctO | |
| S. iniae A00155 (1228bp) | EUO86701 | L. calcarifer (2007) | LctO | |
| S. iniae QMA00177 (1248bp) | EU086704 | L. calcarifer (2007) | LctO | |
| S. iniae QMA00173 (1185bp) | EU086703 | L. calcarifer (2007) | LctO | |
| S. iniae QMA00165 (1176bp) | EU086702 | L. calcarifer (2007) | LctO | |
| Brazil | S. iniae S122-06 (398bp) | FJ803994 | Oreochromis niloticus (2010) | 16S rRNA |
| S. iniae S123-06 (522bp) | FJ803995 | O. niloticus (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae S124-06 (522bp) | FJ803996 | O. niloticus (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae S125-06 (702bp) | FJ803997 | O. niloticus (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae S127-06(696bp) | FJ803998 | O. niloticus (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae S128-06 (500bp) | FJ803999 | O. niloticus (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae S129-06 (688bp) | FJ804000 | O. niloticus (2010) | 16S rRNA | |
| Chile | L. garvieae 30L (817bp) | FJ151399 | Aplodactylus punctatus (2008) | 16S rRNA |
| China | S. iniae CGX (870bp) | EF126045 | Tilapia (2006) | |
| S. iniae CGX (1447bp) | DQ985468 | Tilapia (2006) | LctO | |
| S. iniae SF1 (501bp) | GQ891547 | Japanese flunder (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae DGX01 (1500bp) | HM053435 | Channel cat fish (2010) | 16S rRNA | |
| S. iniae YG1 (1168bp) | GQ169798 | Selenotoca multifasciata (2009) | 16S rRNA | |
| S. iniae DGX070902 (1497bp) | FJ951434 | Channel cat fish (2009) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS004 (1465bp) | EU620577 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS005 (1463bp) | EU620578 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS006 (1464bp) | EU620579 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS003 (1464bp) | EU620580 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS007 (1464bp) | EU622508 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS008 (1464bp) | EU622509 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS009 (1463bp) | EU622510 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS0010 (1463bp) | EU622511 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS0011 (1463bp) | EU622512 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS0012 (1463bp) | EU622513 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS0013 (1463bp) | EU622514 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| S. iniae CMS0014 (1463bp) | EU622515 | Unknown fish (2008) | 16S rRNA | |
| L. garvieae T030817-1 (1427bp) | DQ010113 | Paralichthys olivaceus (2005) | 16S rRNA | |
| L. garvieae FLG2 (1544bp) | AF352163 | Mugil cephalus (2002) | 16SrRNA | |
| L. garvieae FLG4 (1544bp) | AF352164 | M. cephalus (2002) | 16SrRNA | |
| L. garvieae FLG5 (1544bp) | AF352165 | M. cephalus (2002) | 16SrRNA | |
| L. garvieae FLG12 (1544bp) | AF352166 | M. cephalus (2002) | 16SrRNA | |
| Iran | S. iniae Ir-D (746bp) | GQ850377 | Oncorhynchus mykiss (2009) | LctO |
| S. iniae SF2 (1384bp) | FJ870987 | O. mykiss (2009) | 16SrRNA | |
| S. iniae 0141-4 (344bp) | HM055574 | O. mykiss (2010) | 16SrRNA | |
| S. iniae LHK2 (369bp) | HM055573 | O. mykiss (2010) | 16SrRNA | |
| S. iniae LG3 (407bp) | HM055572 | O. mykiss (2010) | 16SrRNA | |
| L. garvieae 195A (409bp) | HM055571 | O. mykiss (2010) | 16SrRNA | |
| L. garvieae Ir-170A (856bp) | GQ850376 | O. mykiss (2009) | 16SrRNA | |
| L. garvieae Ir-0160 (852bp) | GQ850375 | O. mykiss (2010) | 16SrRNA | |
| L. garvieae Fars (1007bp) | EU727199 | O. mykiss (2008) | 16SrRNA | |
| Israel | S. iniae Dan1 (1490bp) | AF335573 | O. mykiss (2001) | 16SrRNA |
| S. iniae S41 (654bp) | AY260834 | O. mykiss (2003) | 16S rRNA | |
| S. iniae ATCC29178 (1536bp) | AF335572 | O. mykiss (2001) | 16S rRNA | |
| S. iniae ATCC29178 (1536bp) | NR-025148 | O. mykiss (2009) | 16S rRNA | |
| Japan | L. garvieae E1 (1506bp) | AB018211 | Cyprinus carpio (2000) | 16S rRNA |
| L. garvieae Lg2 (1471bp) | AB267897 | Seriola quinqueradiata (2006) | 16S rRNA | |
| L. garvieae Lg2-S(1471bp) | AB267898 | S. quinqueradiata (2006) | 16S rRNA | |
| L. garvieae KG9502 (1471bp) | AB267899 | S. quinqueradiata (2006) | 16S rRNA | |
| Singapore | S. iniae DB39299/02 (533bp) | DQ193527 | Red tilapia (2005) | 16S rRNA |
| Taiwan | S. iniae SCCS101 (510bp) | AY465111 | Rachycentron canadum (2004) | 16S rRNA |
| S. iniae SCCS102 (517bp) | AY480053 | R. canadum (2004) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS103 (513bp) | AY480054 | R. canadum (2004) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS104 (506bp) | AY737430 | R. canadum (2005) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS106 (497bp) | AY737432 | R. canadum (2005) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS107 (497bp) | AY737433 | R. canadum (2005) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS108 (497bp) | AY737434 | R. canadum (2005) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS109 (497bp) | AY737435 | R. canadum (2005) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS110 (522bp) | AY489403 | R. canadum (2004) | 16S rRNA | |
| S. iniae SCCS111 (520bp) | AY489404 | R. canadum (2004) | 16S rRNA | |
| Thailand | S. iniae JW1 (1120bp) | GQ169769 | Oreochromis niloticus (2009) | 16S rRNA |
| S. iniae JW3 (1130bp) | GQ338313 | O. niloticus (2009) | 16S rRNA | |
| S. iniae JW4 (1118bp) | GQ169770 | O. niloticus (2009) | 16S rRNA | |
| S. iniae JW6 (1120bp) | GQ338314 | O. niloticus (2009) | 16S rRNA | |
| S. iniae JW7 (1114bp) | GQ169771 | O. niloticus (2009) | 16S rRNA | |
| S. iniae JW9 (1141bp) | GQ338315 | O. niloticus (2009) | 16S rRNA | |
| USA | S. iniae ATCC29178 (534bp) | AY577823 | Unknown fish (2004) | 16S rRNA |