Skip to main content
. 2012 Feb 29;3:70. doi: 10.3389/fmicb.2012.00070

Table A1.

Operational taxonomic units (OTU) of archaea, bacteria, and fungi identified at three depths in peatlands across the James Bay Lowlands, Canada using terminal restriction fragment length polymorphism analysis (T-RFLP) of rDNA.

Site T-RF length Proportion within each depth
0–10 cm 50–60 cm 100–110 cm
ARCHAEA
Kinoje bog 51 0.73
178 1.00 0.25
384 0.02
483 0.75 0.25
Victor bog 51 0.03
178 0.03 0.03
193 0.07 0.07
384 0.43 0.45 0.60
483 0.41 0.42 0.40
729 0.03 0.03
Victor fen 51 0.07
67 0.04
75 0.05 0.11
83 0.11 0.10 0.42
249 0.04
277 0.27 0.26 0.11
384 0.28 0.20 0.14
483 0.34 0.23 0.13
729 0.04 0.05
BACTERIA
Kinoje bog 59 0.02
61 0.07
66 0.88 0.15 0.04
82 0.08 0.02
89 0.41 0.01
136 0.02
140 0.02 0.13
144 0.03 0.03 0.02
160 0.02
165 0.12
260 0.10 0.04
429 0.02
447 0.03
476 0.17
481 0.26
484 0.24
491 0.03
509 0.02
Victor bog 54 0.06
59 0.04
61 0.01 0.07 0.04
66 0.37 0.13 0.08
89 0.03 0.08 0.10
110 0.02
123 0.02
133 0.03
136 0.09 0.16 0.15
140 0.07
144 0.08 0.14 0.20
147 0.01
160 0.01
165 0.01 0.07 0.08
260 0.04 0.06
280 0.03
284 0.04
301 0.02
429 0.03
432 0.01
447 0.03
450 0.01
476 0.15 0.14
484 0.22
496 0.02
519 0.04
Victor fen 66 0.30 0.60 0.30
79 0.07
89 0.04
97 0.04
144 0.19
176 0.04
484 0.21 0.08 0.30
496 0.13
513 0.21 0.12
519 0.10 0.06
521 0.15 0.06
193 0.34 0.05
FUNGI
Kinoje bog 150 0.32 0.83 0.85
178 0.03
193 0.34 0.05
294 0.08
306 0.15 0.06 0.10
328 0.20
Victor bog 150 0.64 0.82 0.18
153 0.82
193 0.29 0.04
294 0.06
306 0.07 0.03
799 0.05
Victor fen 150 0.09 0.61 0.24
178 0.06
193 0.72 0.17 0.16
306 0.19 0.22 0.53

Each OTU is represented by a terminal restriction fragment (T-RF) expressed as a proportion of the total sample (e.g., Kinoje Bog 0–10 cm).