Table 6.

Sequence homology of wheat ctDNA-homologous mtDNA segments to the wheat ct genome, mt genomes of 10 green plant taxa and two prokaryote genomes^a) and their presumed origins

MtDNA segment		Sequence homology (%) of wheat mtDNA segment to:													Deduced origin of ctDNA- homologous wheat mtDNA
		Wheat ct genome	Mt genome of ten green plant species;										Prokaryote genome
No.	Size (bp)		Monocotyledon			Dicotyledon			Gymno- sperm	Bryophyta		Green alga	Cyano- bacterium (Pm)	α-Proteo- bacterium (Pu)
			Rice	Maize	Sorghum	Arabi- dopsis	Sugar beet	Tobacco		Moss	Liver- wort
1a	54	83**	98**	100**	100**	98**	100**	100**	96**	91**	85**	93**	85**	76**	Prokaryoteb)
2	77	82**	100**	100**	100**	97**	100**	97**	97**	96**	96**	37	27	71**	″
12	793	67**	100**	99**	99**	94**	94**	94**	91**	86**	80**	76**	60**	74**	″
18	116	96**	98**	97**	98**	38*	44**	44**	45**	43**	41**	37**	53**	37**	″
19a	27	100**	100**	100**	100**	85**	81**	81**	74*	81**	81**	70*	82**	82**	″
20	46	85**	100**	100**	100**	63**	50**	37	46*	57**	48*	48*	93**	85**	″
24c)	73	95**	100**	100**	100**	100**	100**	100**	96**	58**	52**	58**	55**	34	″
28	82	96**	99**	28	99**	99**	96**	96**	40*	40*	49**	56**	70**	49**	″
30a	64	83**	100**	100**	100**	100**	100**	100**	95**	95**	80**	53**	72**	80**	″
31c)	45	89**	96**	53*	100**	47*	49*	56**	58**	53**	62**	67**	67**	47*	″
40	177	72**	100**	99**	100**	93**	96**	95**	91**	84**	85**	72**	58**	31**	″
41a	1,932	76**	86**	98**	99**	91**	91**	85**	78**	70**	69**	58**	77**	77**	″
43a	3,145	76**	99**	99**	99**	84**	90**	80**	73**	69**	67**	54**	78**	76**	″
45	65	98**	77**	85**	77**	78**	78**	95**	77**	82**	82**	74**	86**	82**	″
46	86	99**	100**	100**	100**	88**	87**	87**	55**	47**	67**	71**	71**	62**	″
47a	59	80**	100**	100**	100**	100**	100**	100**	98**	93**	93**	86**	76**	85**	″
48	65	82**	100**	100**	100**	94**	95**	94**	94**	62**	62**	78**	82**	83**	″
51	39	82**	95**	97**	97**	97**	95**	97**	95**	87**	38	87**	69*	54	″
52	43	81**	100**	100**	100**	98**	100**	100**	95**	93**	81**	65**	49*	40	Green plant
53a	32	81**	100**	100**	100**	94**	94**	94**	94**	94**	88**	88**	0	0	″
16	195	91**	95**	13	99**	84**	75**	72**	42**	15	18*	17*	38**	32**	Angiosperm
29	61	95**	100**	38	100**	41	87**	95**	30	26	34	38	39	41	″
36	32	97**	100**	100**	100**	91**	75**	91**	53	63	56	63	56	53	″
37	30	83**	87**	87**	87**	83**	70*	83**	40	50	53	43	63	53	″
17	220	80**	97**	99**	96**	12	15**	13*	12	10	10	10	19**	12	Monocotyledon
22	58	91**	97**	100**	100**	47*	33	40	34	29	26	31	34	34	″
34	120	87**	100**	51**	97**	18	19	27*	23	18	20	20	22	25	″
3	445	78**	62**	39**	39**	7	7	5	7	6	6	6	15**	12**	Cereald)
4	69	96**	93**	30	93**	33	35	46*	35	29	39	36	38	43	″
21	32	97**	91**	59	53	38	59	69*	63	47	50	47	53	53	″
33	135	94**	17	21	97**	17	21	18	13	13	13	16	20	16	″
35	370	84**	96**	6	95**	6	5	7	6	5	6	6	40**	9*	″
38	54	98**	41	96**	37	35	31	43	35	44*	30	33	39	30	″
39	4,319	98**	3	98**	1	1	34**	37**	1	1	29**	3	6	4	″
42	1,833	100**	3	64**	34**	4	9*	12**	2	3	3	3	14**	10**	″
49	67	90**	22	31	100**	30	31	24	28	37	28	24	30	27	″
5	34	91**	44	62	62	50	62	50	53	50	44	50	59	56	Wheat
6	36	92**	39	47	44	64	44	56	64	47	53	53	64	56	″
7	59	86**	27	34	44*	34	42	42	46*	27	27	32	34	39	″
9	29	100**	52	62	69*	62	62	55	48	55	62	69*	69*	69*	″
15	210	90**	14*	14*	15**	11	10	9	34**	10	10	15**	14*	12	″
32	176	95**	27**	14	16*	13	19**	13	16*	14	12	13	28*	20**	″
50	398	92**	9*	12**	9*	8	9*	9*	9*	8	8	7	40**	11**	″
54	180	91**	16*	15	13	18**	17**	10	16*	16*	17**	11	18**	17**	″
8	58	97**	98**	98**	98**	43	64**	40	38	31	40	41	53**	48*	Recurrent transfer
14	446	100**	4	7	8	4	6	64**	4	4	6	4	32**	6	″
23	53	89**	49*	36	89**	38	38	25	79**	34	32	53*	43	43	″
25	189	88**	13	14	14	12	9	88**	11	8	14	10	13	12	″
26	172	91**	15	17**	13	12	12	88**	16*	17**	16*	15	27**	14	″
27	105	96**	21	19	17	23	20	88**	21	16	22	18	23	21	″
11	1,110	98**	61**	47**	47**	26**	26**	46**	25**	46**	30**	26**	53**	24**	Undetermined
13	526	87**	88**	20**	20**	28**	20**	19**	16**	16**	23**	26**	28**	12**	″
Reference: Wheat ct-rbcL
rbcL	1,434	2e)	96**	92**	94**	34**	1	2	75**	1	2	1	81**	2	Recurrent transfer

a) Sequence homology (%) = [No. matched nucleotides]/[Wheat mt-segment size (bp)] × 100. Significant sequence homology at the 5% and 1% levels of probability are shown by * and **, respectively.

b) Synonymous to the orthologous origin.

c) The indicated origin is inconsistent with the genes located.

d) “Cereal” means the occurrence of ctDNA transfer in cereals after divergence of the cereal from other groups of monocotyledon.

e) No sequence homology between the wheat ct-rbcL and any wheat mt segments.