Table 2.
Identification and further characterization of the 91 ESBL producers isolated from 334 healthy food-producing animals at slaughter and from 67 Escherichia coli mastitis milk samples in Switzerland
| Sample number | Origin | Species | Expressed ESBL & accompanying β- lactamase | β-lactam antibiotic resistances | Additional resistance | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AM | AMC | CF | CXM | CPD | CTX | CAZ | FEP | FOX | IPM | |||||
| 13 | pig | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | ss | s | NA. S, SXT, TE |
| 14 | pig | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | ia | s | s | NA, TE |
| 64 | pig | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | SXT |
| 65 | pig | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 17 | pig | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | CIP, NA, S, TE |
| 18 | pig | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | r | sa | ia | s | s | C, CIP, NA, S, SXT, TE |
| 72 | pig | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | S, SXT |
| 60 | pig | E. coli | CTX-M-1 & TEM-186 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | S, SXT |
| 16 | pig | E. coli | CTX-M-14 & TEM-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | CIP, GM, NA, S, SXT, TE |
| 46 | calf | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 112 | calf | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 114 | calf | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 142.09_b | calf | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 142.09_g | calf | C. youngae | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 68 | young cow | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA |
| 128 | calf | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | r | s | s | S, SXT, TE |
| 136 | calf | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | CIP, NA, TE |
| 129 | calf | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | S, SXT, TE |
| 104 | calf | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 47 | calf | E. coli | CTX-M-15 | r | s | r | r | r | r | ia | sa | s | s | C, GM, S, SXT, TE |
| 52 | calf | E. coli | CTX-M-15 | r | s | r | r | r | r | ia | r | s | s | CIP, NA, GM, SXT, TE |
| 53 | calf | E. coli | CTX-M-15 | r | i | r | r | r | r | ia | ia | s | s | CIP, NA |
| 124 | calf | E. coli | CTX-M-15 | r | s | r | r | r | r | r | sa | s | s | CIP, NA, S |
| 142.11_n | calf | E. coli | CTX-M-117 & TEM-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, CIP, GM, NA, S, SXT, TE |
| 115 | calf | E. coli | CTX-M-14 & TEM-1 | r | i | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, CIP, NA, SXT |
| 116 | calf | E. coli | CTX-M-14 & TEM-1 | r | i | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, CIP, GM, NA, S, SXT, TE |
| 2 | lamb | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | C, NA, S, TE |
| 108 | sheep | E. coli | CTX-M-15 & TEM-1 | r | i | r | r | r | r | ia | ia | s | s | CIP, GM, S, SXT, TE |
| 100 | sheep | E. coli | CTX-M-14 & TEM-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, CIP, GM, NA, S, TE |
| 102 | sheep | E. coli | CTX-M-14 & TEM-1 | r | i | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, CIP, GM, NA, S, TE |
| 11 | lamb | E. cloacae | SHV-12 & TEM-1 | r | r | r | r | r | ia | r | sa | r | s | C, S, SXT, TE |
| 3 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 4 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | TE |
| 8 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 10 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | S, SXT, TE |
| 12 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 16 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 17 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 26 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | TE |
| 30 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | TE |
| 31 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 33 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | ia | s | s | NA, TE |
| 35 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | r | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 40 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 41 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | SXT |
| 42 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 43 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 44 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 45 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, SXT |
| 46 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 47 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | S, SXT, TE |
| 48 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 49 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | S, SXT, TE |
| 51 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 52 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 53 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 58 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | GM, NA, SXT, TE |
| 59 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, SXT, TE |
| 60 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 62 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 63 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 64 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, SXT |
| 65 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | TE |
| 67 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 68 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 73 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 74 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | TE |
| 76 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA |
| 78 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 86 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | TE |
| 87 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | TE |
| 88 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, SXT |
| 91 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, TE |
| 92 | chicken | E. coli | CTX-M-1 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | S, TE |
| 94 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | TE |
| 96 | chicken | E. coli | CTX-M group 1+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 20 | chicken | E. coli | CTX-M group 1/TEM+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | CIP, NA, SXT, TE |
| 27 | chicken | E. coli | CTX-M group 1/TEM+ | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | S, SXT, TE |
| 32 | chicken | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 36 | chicken | E. coli | CTX-M group 1/TEM+ | r | i | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 82 | chicken | E. coli | CTX-M group 1/TEM+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 84 | chicken | E. coli | CTX-M-1 & TEM-1 | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 85 | chicken | E. coli | CTX-M group 1/TEM+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 97 | chicken | E. coli | CTX-M group 1/TEM+ | r | s | r | r | r | r | sa | sa | s | s | SXT, TE |
| 5 | chicken | E. coli | SHV-12 | r | s | r | ia | r | ia | ia | sa | s | s | - |
| 2 | chicken | E. coli | SHV-12 | r | s | r | ia | r | ia | sa | sa | s | s | C, NA, TE |
| 34 | chicken | E. coli | SHV-12 & TEM-1 | r | s | r | sa | r | sa | ia | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 77 | chicken | E. coli | SHV-12 & TEM-1 | r | s | r | ia | r | ia | ia | sa | s | s | NA, SXT, TE |
| 23 | chicken | E. coli | TEM-52 | r | s | r | ia | r | ia | sa | sa | s | s | NA |
| 70 | chicken | E. coli | TEM-52 | r | s | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | NA |
| 1,006 | mastitis milk | E. coli | CTX-M-14 & TEM-1 | r | r | r | r | r | ia | sa | sa | s | s | C, GM, NA S, SXT, TE |
+) not further characterized
s, sensitive; i, intermediate; r, resistant
a) It is known that many ESBL producers may appear susceptible or intermediate to oxyimino cephalosporins in vitro if CLSI criteria are applied strictly, but do not respond to the respective therapies. Consequently, for clinical reporting these results have to be corrected to "resistant".
AM, ampicillin; AMC, amoxicillin-clavulanic acid; CF, cephalothin; CXM, cefuroxime; CPD, cefpodoxime; CTX, cefotaxime; CAZ, ceftazidime; FEP, cefepime; FOX, cefoxitin; IPM, imipenem
C, chloramphenicol; CIP, ciprofloxacin; GM, gentamicin; NA, nalidixic acid; S, streptomycin; SXT, trimethoprim-sulfamethoxazole; TE, tetracycline