Table 3.

MAFs of SNPs in Progressors and Nonprogressors at Each Transition

SNP	Gene	Transition Minor Allele	1 → 2		2 → 3		3 → 4		3 → 5
			Non*	Pro*	Non*	Pro*	Non*	Pro*	Non*	Pro*
Subjects, n			219	494	814	376	949	280	949	298
rs1061170	CFH	C	0.37	0.39	0.36	0.43	0.44	0.62	0.44	0.62
rs10490924	ARMS2/HTRA1	T	0.17	0.21	0.20	0.28	0.28	0.41	0.28	0.41
rs9332739	C2	C	0.06	0.05	0.05	0.04	0.04	0.02	0.04	0.02
rs641153	CFB	T	0.11	0.09	0.09	0.07	0.08	0.05	0.08	0.04
rs2230199	C3	G	0.19	0.21	0.20	0.25	0.24	0.32	0.24	0.31
rs10033900	CFI	T	0.45	0.51	0.49	0.49	0.49	0.57	0.49	0.49
rs10468017	LIPC	T	0.34	0.29	0.28	0.28	0.29	0.24	0.29	0.26
rs9621532	TIMP3	C	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.04	0.06	0.04
rs3764261	CETP	A	0.31	0.34	0.33	0.35	0.34	0.33	0.34	0.39
rs1883025	ABCA1	T	0.32	0.24	0.26	0.21	0.24	0.24	0.24	0.25
rs13095226	COL8A1	C	0.09	0.11	0.11	0.07	0.08	0.14	0.08	0.12
APOE†	APOE	E4	0.14	0.13	0.12	0.10	0.12	0.09	0.12	0.10

^*Nonprogressors (Non) groups and progressors (Pro) for each transition in the five-state Markov model.

^†APOE haplotypes were defined by alleles in rs7412 and rs429358.