Table 1.
Locus and allele size, bp (allele no.) | No. (%) of isolates (n = 164) | No. of farms (n = 96) | No. of human isolates (n = 14) |
|
---|---|---|---|---|
C. parvum | C. hominis | |||
MS1 | ||||
326 (1) | 2 (1.2) | 2 | ||
350 (2) | 51 (31) | 34 | 4 | |
362 (3) | 108 (66) | 60 | 5 | |
386 (4) | 3 (1.8) | 1 | ||
374 (5) | 5 | |||
MS9 | ||||
396 (1) | 1 (0.6) | 1 | ||
420 (2) | 3 (1.8) | 1 | ||
432 (3) | 15 (9.1) | 9 | ||
438 (4) | 22 (13.4) | 11 | 2 | |
444 (5) | 13 (7.9) | 6 | ||
450 (6) | 94 (57.3) | 68 | 4 | |
456 (7) | 12 (7.3) | 11 | 1 | |
462 (8) | 4 (2.4) | 3 | 2 | |
373 (9) | 5 | |||
TP14 | ||||
297 (1) | 18 (11) | 17 | 1 | |
300 (2) | 47 (28.6) | 39 | 3 | |
309 (3) | 99 (60.3) | 64 | 4 | |
318 (4) | 1 | |||
255 (5) | 4 | |||
261 (6) | 1 | |||
MM5 | ||||
218 (1) | 1 (0.6) | 1 | 1 | |
224 (2) | 7 (4.2) | 7 | ||
233 (3) | 64 (39) | 39 | 2 | |
242 (4) | 1 (0.6) | 1 | ||
260 (5) | 90 (54.9) | 63 | 6 | |
275 (6) | 1 (0.6) | 1 | ||
MM18 | ||||
236 (1) | 2 (1.2) | 1 | ||
242 (2) | 24 (14.6) | 11 | 2 | |
248 (3) | 31 (18.9) | 24 | 2 | |
260 (4) | 1 (0.6) | 1 | ||
290 (5) | 106 (64.6) | 72 | 5 | |
206 (6) | 5 | |||
MM19 | ||||
263 (1) | 2 (1.2) | 1 | ||
281 (2) | 11 (6.7) | 6 | 1 | |
287 (3) | 62 (37.8) | 47 | 1 | |
293 (4) | 10 (6.1) | 8 | 3 | |
299 (5) | 1 (0.6) | 1 | 1 | |
305 (6) | 1 (0.6) | 1 | ||
317 (7) | 11 (6.7) | 7 | ||
323 (8) | 19 (11.6) | 13 | 1 | |
329 (9) | 1 (0.6) | 1 | ||
335 (10) | 22 (13.4) | 15 | 1 | |
341 (11) | 2 (1.2) | 2 | ||
353 (12) | 7 (4.2) | 3 | 1 | |
365 (13) | 6 (3.6) | 4 | ||
377 (13) | 2 (1.2) | 1 | ||
389 (14) | 3 (1.8) | 3 | ||
395 (15) | 2 (1.2) | 1 | ||
>400 (16) | 2 (1.2) | 2 | ||
233 (17) | 4 | |||
245 (18) | 1 | |||
GP15 | ||||
306 (1) | 2 (1.2) | 2 | ||
315 (2) | 1 | |||
318 (3) | 5 (3) | 1 | ||
321 (4) | 12 (7.3) | 9 | ||
324 (5) | 11 (6.7) | 7 | ||
330 (6) | 97 (59.1) | 60 | 6 | |
333 (7) | 1 (0.6) | 1 | ||
336 (8) | 18 (11) | 17 | 1 | |
339 (9) | 13 (7.9) | 11 | 1 | |
342 (10) | 2 (1.2) | 2 | ||
345 (11) | 1 (0.6) | 1 | ||
354 (12) | 2 (1.2) | 1 | ||
366 (13) | 5 |