TABLE 2.

Campylobacter, Staphylococcus, and other zoonotic pathogens identified

Farm	Sample no.	Animal	Campylobacter species identified	Species identified by 16S-UNI-L/R sequencing	Staphylococcus species identified
1	1	Goat 1	C. coli		S. succinus
	2	Goat 2			S. warneri
	3	Goat 3	C. coli		S. equorum
	4	Goat 4			S. equorum, S. xylosus
	5	Goat 5
2	6	Goat 1
	7	Goat 2	C. jejuni
	8	Sheep 3	C. jejuni
	9	Sheep 4
	10	Sheep 5
3	11	Sheep 1		Enterococcus spp.	S. xylosus
	12	Sheep 2			S. xylosus
	13	Sheep 3			S. xylosus
	14	Sheep 4			S. aureus
	15	Sheep 5		Ochrobactrum intermedium	S. aureus
	16	Sheep 6		Ochrobactrum intermedium	S. aureus
	17	Goat 7		Ochrobactrum intermedium	S. succinus, S. xylosus
	18	Goat 8		Ochrobactrum intermedium	S. xylosus
4	19	Goat 1		Acinetobacter spp.
	20	Goat 2		Ochrobactrum anthropi	S. xylosus
	21	Sheep 3		Ochrobactrum anthropi
5	22	Goat 1		Acinetobacter spp.	S. sciuri
	23	Goat 2		Acinetobacter spp.	S. equorum
	24	Goat 3			S. sciuri, S. vitulinus
	25	Goat 4		Ochrobactrum anthropi	S. aureus
	26	Goat 5			S. xylosus
	27	Goat 6
	28	Sheep 7		Ochrobactrum anthropi	S. aureus
	29	Sheep 8	C. jejuni		S. xylosus
6	30	Goat 1	C. jejuni		S. equorum
	31	Goat 2			S. xylosus
	32	Goat 3			S. xylosus
	33	Goat 4			S. xylosus
	34	Sheep 5	C. jejuni		S. vitulinus
	35	Sheep 6			S. xylosus
	36	Sheep 7	C. jejuni		S. vitulinus
	37	Sheep 8	C. jejuni		S. xylosus
	38	Sheep 9			S. vitulinus
7	39	Goat 1
	40	Goat 2			S. xylosus
	41	Goat 3			S. xylosus
	42	Goat 4			S. xylosus
8	43	Sheep 1
	44	Sheep 2			S. succinus
	45	Sheep 3		Mixed culture (including L. plantarum)	S. aureus
	46	Goat 4			S. aureus
	47	Goat 5		Acinetobacter sp.	S. aureus
	48	Goat 6		Lactobacillus plantarum