Table 5.

Stop codons detected at a prevalence of ≥2% by direct polymerase chain reaction sequencing or ultra-deep pyrosequencing.

		Samples from NRTI-naive patients (HBV type), %							Samples from NRTI-treated patients (HBV type), %
S protein	RT Mutation	7774-0 (A)	A7 (B)	B1 (B)	B5 (B)	C2 (C)	C7 (C)	D3 (A)	7774-1 (A)	7774-2 (A)	1329-1 (A)	1329-2 (A)	C5 (B)	26278-1 (G)	26278-2 (G)	26278-3 (G)	HTT (B)	1284-2 (G)
W35*	Silent	…	…	2.3	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…
W36*	Silent	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	2.5	…
S61*	Silent	…	…	…	5.6	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…
C69*	Silent	…	…	…	…	31	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…
W74*	Silent	43	…	…	…	19	26	…	…	27	…	…	27	…	…	…	…	…
C107*	S116T	19	…	…	…	…	…	…	7.7	62	…	…	…	…	…	…	…	…
W172*	A181T	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	4.1
W182*	V191I	…	…	…	…	41	…	3.1	…	…	2.9	2.9	…	5.4	5.3	3.6	…	…
W191*	Silent	…	2.5	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	2.0	…
W196*a	Silent/M204I	…	3.0	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	52	56	51	…	…
W199*a	Silent/V207I	3.1	…	…	…	…	…	…	…	3.7	…	…	…	51	55	49	…	…
W201*	Silent	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	…	52	54	49	…	…
L216*	Silent	35	…	…	…	…	…	…	9.8	73	22	33	14	…	…	…	…	…

NOTE. Data are the percentage of ultra-deep pyrosequencing reads with a stop codon at that position. Underlining indicates stop codons that were also detected by direct polymerase chain reaction sequencing.

^aDepending on the genetic context, W196* and W199* can be caused by M204I and M207I, respectively, or by silent reverse-transcriptase (RT) mutations.