Table 5.

Frequencies and Analysis of the CTLA4 Haplotype–PD1.3 SNP Interaction: Additive Model

CTLA4-PDCD1	Frequency		P Value	Frequency		P Value	Frequency		P Value
	PBC (n = 351)	Control (n = 205)		AMA+ PBC (n = 303)	AMA− PBC (n = 44)		OLT (n = 29)	Non-OLT (n = 322)
A:A-G	0.366	0.408	0.47	0.362	0.427	0.42	0.237	0.378	0.03
A:A-A	0.061	0.022	0.05	0.057	0.073	0.06	0.031	0.066	0.28
A:G-G	0.153	0.170	0.45	0.152	0.177	0.43	0.214	0.150	0.29
A:G-A	0.022	0.028	0.49	0.020	0.028	0.59	0	0.023	0.44
G:G-G	0.355	0.306	0.26	0.370	0.225	0.02	0.424	0.351	0.17
G:G-A	0.043	0.068	0.43	0.039	0.070	0.48	0.093	0.033	0.06
Global P value	0.132			0.274			0.104

Bold text indicates statistically significant findings (i.e., P ≤ 0.05).