Table 3. Expression of Cas proteins from S. thermophilus DGCC710 across time.
Protein | Description | Loci | MOI = 1 | MOI = 0.1 | MOI = 0 | |||||||||||||||
0 | 0.5 | 1 | 2 | 4 | 24 | 0 | 0.5 | 1 | 2 | 4 | 24 | 0 | 0.5 | 1 | 2 | 4 | 24 | |||
ST89_070900 | Cas9 | CRISPR1 | 15 | 6 | 89 | 80 | 9 | 8 | 16 | 12 | 18 | 48 | 33 | 16 | 18 | 21 | 17 | 22 | 21 | 17 |
ST89_071000 | Cas1 | |||||||||||||||||||
ST89_071100 | Cas2 | |||||||||||||||||||
ST89_071200 | Cas4 | |||||||||||||||||||
ST89_097000 | Cas1 | CRISPR2 | 1 | |||||||||||||||||
ST89_097100 | Cas2 | |||||||||||||||||||
ST89_097200 | Cas6 | |||||||||||||||||||
ST89_097300 | Cas10 | 2 | 1 | 1 | ||||||||||||||||
ST89_097400 | Csm2 | 1 | 1 | |||||||||||||||||
ST89_097500 | Csm3 | 4 | 3 | 3 | 2 | 4 | 2 | 2 | 1 | 4 | 2 | 4 | 2 | 4 | 4 | 4 | ||||
ST89_097600 | Csm4 | 1 | 1 | 1 | 4 | 1 | 1 | |||||||||||||
ST89_097700 | Csm5 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 4 | 1 | |||||||||||
ST89_097800 | Csm6 | |||||||||||||||||||
ST89_147700 | Cas9 | CRISPR3 | 7 | 6 | 61 | 50 | 8 | 7 | 10 | 10 | 19 | 10 | 8 | 7 | 4 | 7 | 10 | 10 | 8 | |
ST89_147600 | Cas1 | |||||||||||||||||||
ST89_147500 | Cas2 | |||||||||||||||||||
ST89_147400 | Csn2 | |||||||||||||||||||
ST89_103880 | Cas3 | CRISPR4 | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 2 | |||||||||||
ST89_103870 | Cse1 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||
ST89_103860 | Cse2 | 1 | 5 | 1 | 1 | 1 | 2 | 1 | 3 | 1 | 1 | 1 | ||||||||
ST89_103850 | Cas7 | 19 | 23 | 101 | 58 | 16 | 11 | 14 | 19 | 12 | 29 | 15 | 15 | 10 | 11 | 9 | 10 | 8 | 12 | |
ST89_103840 | Cas5 | 2 | 3 | 1 | 2 | 4 | 3 | 3 | 5 | 1 | 2 | 3 | 2 | 1 | ||||||
ST89_103830 | Cas6e | 6 | 6 | 23 | 18 | 6 | 7 | 2 | 2 | 2 | 2 | 1 | 8 | 1 | ||||||
ST89_103820 | Cas1 | 7 | 2 | 1 | ||||||||||||||||
ST89_103810 | Cas2 |
Values are averaged normalized spectral counts taken at each time point from cells infected at MOI = 1, MOI = 0.1, and uninfected cells (MOI = 0). All Cas proteins were detected by unique peptides.