Table 1.

Cytology, histology and LCM-PCR results

	Cytology		Histology				LCM
Case	Diagnosis	HPV (LA signal intensity)†	Clinical diagnosis	Consensus tissue	p16 staining*	HPV	Total no. LCM regions	No. LCM regions:negative	Single HPV types by LCM (# areas)	Multiple HPV types by LCM (# areas)
Single HPV infections in cytology
1	ASC-H	16(s)	CIN 1	Neg	0	Neg	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 2	CIN 2	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 2	CIN 2	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16	1	0	16 (1)	0
2	HSIL	35(s)	CIN 3	CIN 3	4	35	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	35	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	35	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	35	1	0	35 (1)	0
3	HSIL	16(s)	Neg	CIN 2	3	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16	1	0	16 (1)	0
4	Inv. ca.**	18(s)	CIN 3	CIN 3	4	18	1	0	18 (1)	0
			CIN 3	CIN 3	4	18	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 2	3	18	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 2	4	18	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
5	HSIL	16(s)	CIN 3	CIN 3	4	16	1	0	16 (1)	0
			CIN 3	CIN 3	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	Neg	1	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			Neg	Neg	1	Neg	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
Multiple HPV infections in cytology
6	ASC-H	16(s), 52(ew), 55(vw)	Neg	Neg	0	Neg	2	2	n.a.***	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16	8	0	16 (8)	0
			CIN 3	CIN 3	4	16	9	1	16 (8)	0
			CIN 1	Neg	0	16	8	8	n.a.	n.a.
7	HSIL	42(m), 53(s), 55(s), 66(ew), 67(s), 73(s)	Neg	Neg	0	51	4	4	n.a.	n.a.
			Neg	Neg	0	73	2	2	n.a.	n.a.
			CIN 2	CIN 2	1	73,53	6	0	73 (6)	0
			CIN 1	CIN 1	3	73	6	0	73 (6)	0
8	LSIL	16(s), 53(s), 68(s)	CIN 3	CIN 2	4	16,68	10	0	16 (10)	0
			CIN 3	CIN 2	4	16,53,68	8	1	16 (7)	0
			CIN 2	CIN 2	4	16,68	10	0	16 (10)	0
			Neg	Neg	1	16,53,68	4	4	n.a.	n.a.
9	HSIL	16(s), 31(s), 42(s)	CIN 3	CIN 3	4	16,31	12	0	16 (4), 31 (7)	16+31 (1)
			CIN 2	CIN 2	4	31	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 3	4	16,31	8	0	16 (8)	0
10	HSIL	16(s), 40(s), 59(s)	CIN 1	CIN 1	2	16,40	16	1	16 (7), 40 (1)	16+40 (7)
			CIN 1	CIN 1	2	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 3	CIN 2	3	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			Neg	Neg	2	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
11	LSIL	16(m), 51(s)	CIN 3	CIN 2	4	16,51	10	1	16 (9)	0
			Neg	CIN 1	2	51	1	0	51 (1)	0
			CIN 1	CIN 1	3	51	1	0	51 (1)	0
			Neg	Neg	1	51	3	1	51 (1)	16+51 (1)
12	ASC-H	16(s), 84(vw)#	CIN 3	CIN 3	4	16	1	0	16 (1)	0
			CIN 1	CIN 1	2	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 2	CIN 2	3	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			CIN 2	CIN 2	3	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
13	HSIL	16(s), 61(m)#	CIN 1	Neg	0	16	3	1	16 (2)	0
			CIN 2	CIN 3	4	16	1	0	16 (1)	0
			CIN 3	CIN 3	4	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.
			Neg	Neg	2	16	n.a.	n.a.	n.a.	n.a.

The figures in parenthesis indicate the number of LCM areas in which single or multiple HPV type(s) were detected in each case

^†LA signal intensity: (s)= strong; (m)= medium; (w)= weak; (vw)=very weak; (ew)= extremely weak

^*0= negative, 1= patchy staining, 2= diffuse staining first 1/3 basal, 3= diffuse staining first 2/3 basal 4= diffuse staining whole epithelium

^**Inv. ca.= Invasive carcinoma

^***n.a.= Not analyzed

^#HPV type not detected by both HPV DNA assays (LA and LiPA25)