Table 2.
RNA binding proteins that copurify with EBNA1
| Identified protein | Accession no. | Molecular mass (kDa) | No. of assigned spectraa |
|||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C666 |
CNE2 |
AGS |
AGS-EBV 0 h |
AGS-EBV 16 h |
||||||||
| β-Gal | EBNA1 | β-Gal | EBNA1 | β-Gal | EBNA1 | β-Gal | EBNA1 | β-Gal | EBNA1 | |||
| EBNA1 | GI:56566195 | 56 | 0 · 0 · 0 | 46 · 16 · 81 | 0 · 0 | 20 · 34 | 0 · 0 | 19 · 7 | 0 · 0 | 26 · 8 | 0 · 0 | 8 · 7 |
| hnRNP A1 | GI:111306451 | 29 | 0 · 3 · 0 | 6 · 48 · 31 | 4 · 2 | 4 · 2 | 0 · 0 | 26 · 10 | 0 · 2 | 12 · 16 | 0 · 0 | 3 · 9 |
| hnRNP A2/B1 | GI:14043072 | 37 | 0 · 3 · 0 | 6 · 28 · 31 | 6 · 5 | 4 · 9 | 0 · 0 | 31 · 6 | 0 · 0 | 2 · 3 | 0 · 0 | 1 · 7 |
| hnRNP A/B | GI:33874222 | 31 | 0 · 0 · 0 | 2 · 1 · 3 | 1 · 0 | 0 · 0 | 0 · 0 | 5 · 0 | 0 · 0 | 13 · 20 | 0 · 0 | 2 · 2 |
| hnRNP A3 | GI:34740329 | 40 | 0 · 0 · 0 | 4 · 0 · 1 | 0 · 0 | 0 · 0 | 0 · 0 | 16 · 3 | 0 · 0 | 5 · 2 | 0 · 0 | 1 · 2 |
| hnRNP D | GI:14110420 | 38 | 0 · 2 · 0 | 6 · 7 · 3 | 3 · 0 | 1 · 0 | 0 · 0 | 13 · 3 | 0 · 0 | 5 · 6 | 0 · 0 | 6 · 4 |
| hnRNP Q | GI:228008291 | 70 | 0 · 0 · 0 | 26 · 3 · 11 | 2 · 2 | 1 · 1 | 0 · 0 | 54 · 9 | 0 · 0 | 50 · 12 | 0 · 0 | 17 · 22 |
| hnRNP R | GI:2697103 | 71 | 0 · 0 · 0 | 19 · 0 · 4 | 0 · 1 | 0 · 2 | 0 · 0 | 34 · 6 | 0 · 0 | 9 · 3 | 0 · 0 | 5 · 14 |
| La protein | GI:10835067 | 47 | 0 · 0 · 0 | 7 · 3 · 17 | 0 · 0 | 0 · 0 | 0 · 0 | 0 · 0 | 0 · 0 | 2 · 4 | 0 · 0 | 4 · 28 |
a
Total number of tryptic peptides identified in individual experiments. Data from individual experiments are separated by dots.