Table 1. Frequency of MIRU-VNTR alleles and allelic diversity at each locus in M. tuberculosis isolates from Taiwan.
MIRU-VNTRlocus | No. of isolates with indicated MIRU allelea | No. AVb | |||||||||||||||
0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | >15 | ||
VNTR2347 (Mtub29) | 1 | 1 | 336 | 3 | |||||||||||||
VNTR2059 (MIRU20) | 2 | 336 | 2 | ||||||||||||||
VNTR2687 (MIRU24) | 335 | 3 | 2 | ||||||||||||||
VNTR2531 (MIRU23) | 1 | 335 | 2 | 3 | |||||||||||||
VNTR3007 (MIRU27) | 1 | 1 | 334 | 2 | 4 | ||||||||||||
VNTR580 (MIRU04) | 3 | 2 | 330 | 1 | 1 | 1 | 6 | ||||||||||
MIRU2461 (ETR-B) | 5 | 328 | 4 | 1 | 4 | ||||||||||||
VNTR1644 (MIRU16) | 8 | 323 | 7 | 3 | |||||||||||||
VNTR577 (ETR-C) | 3 | 3 | 321 | 11 | 4 | ||||||||||||
VNTR2401 (Mtub30) | 18 | 319 | 1 | 3 | |||||||||||||
VNTR3171 (Mtub34) | 11 | 312 | 13 | 2 | 4 | ||||||||||||
VNTR4348 (MIRU39) | 3 | 13 | 303 | 19 | 4 | ||||||||||||
VNTR3690 (Mtub39) | 2 | 2 | 300 | 24 | 9 | 1 | 6 | ||||||||||
VNTR2165 (ETR-A) | 1 | 39 | 296 | 1 | 1 | 5 | |||||||||||
VNTR802 (MIRU40) | 14 | 17 | 297 | 9 | 1 | 5 | |||||||||||
VNTR154 (MIRU02) | 156 | 2 | 10 | 164 | 5 | 1 | 6 | ||||||||||
VNTR960 (MIRU10) | 6 | 51 | 273 | 5 | 2 | 1 | 6 | ||||||||||
VNTR2996 (MIRU26) | 2 | 1 | 1 | 9 | 10 | 49 | 244 | 14 | 3 | 4 | 1 | 11 | |||||
VNTR4156 (QUB4156) | 4 | 58 | 209 | 61 | 5 | 5 | |||||||||||
VNTR1955 (Mtub21) | 1 | 3 | 12 | 126 | 184 | 3 | 3 | 4 | 1 | 1 | 10 | ||||||
VNTR4052 (QUB26) | 2 | 3 | 7 | 4 | 20 | 38 | 216 | 33 | 6 | 5 | 4 | 11 | |||||
VNTR3192 (MIRU31) | 1 | 11 | 175 | 17 | 128 | 4 | 2 | 7 | |||||||||
VNTR424 (Mtub04) | 5 | 6 | 50 | 125 | 148 | 4 | 6 | ||||||||||
VNTR2163b (QUB11b) | 1 | 4 | 22 | 31 | 100 | 145 | 26 | 3 | 1 | 2 | 2 | 11 |
Nā=ā338.
AV, allelic variants.