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. 2012 Jul 18;7(7):e40321. doi: 10.1371/journal.pone.0040321

Table 1. Size of universal reference and probeset dynamic-range estimation Affymetrix Mouse 430 2.0 (45101 probesets).

False positive on probeset dynamic-range estimation (mean±s.e.m.) [%]
Size of common reference (number of microarrray data)
Exp 10 20 40 80 160 320 640 1280 2560 5120
#1 (n = 10) 16.38±1.72 12.99±1.69 4.28±0.98 1.88±0.48 1.19±0.48 0.63±0.27 0.25±0.11 0.11±0.04 0.07±0.03 0.04±0.02
#2 (n = 10) 15.10±1.83 10.67±2.30 3.95±0.91 2.26±0.72 1.00±0.35 0.59±0.25 0.27±0.09 0.14±0.07 0.06±0.02 0.03±0.01
#3 (n = 10) 17.68±2.16 7.50±1.16 4.51±1.02 2.52±0.55 1.18±0.44 0.54±0.19 0.21±0.06 0.12±0.05 0.05±0.02 0.04±0.02
#4 (n = 10) 18.37±2.85 10.88±1.49 5.25±1.11 2.59±0.85 1.05±0.30 0.48±0.15 0.32±0.15 0.13±0.06 0.07±0.03 0.03±0.01
#5 (n = 10) 19.15±2.26 7.86±1.09 4.63±1.10 2.19±0.54 1.27±0.56 0.53±0.17 0.25±0.09 0.13±0.06 0.05±0.02 0.03±0.01
Ave 17.34±0.72 9.98±1.02 4.52±0.22 2.29±0.13 1.14±0.05 0.55±0.03 0.26±0.02 0.13±0.00 0.06±0.00 0.03±0.00