Table 1.
Original gmk allele | Polymorphism(s) | Position(s) | New gmk allele | Original STa | New ST | CC change |
---|---|---|---|---|---|---|
50 | G | 429 | 44 | 377 | 152 | |
1471 | 1471a | |||||
64 | G | 429 | 107 | 1066 | 1277 | |
1067 | 1067a | |||||
68 | T | 426 | 2 | 686 | 489 | |
1697 | 121 | |||||
81 | G | 429 | 129 | 856 | 1643 | |
88 | G | 429 | 1 | 931 | 8 | |
1283 | 239 | |||||
1441 | 15 | |||||
1476 | 97 | |||||
1494 | 1465 | |||||
1595 | 25 | |||||
1738 | 1 | |||||
2129 | 2129a | |||||
2136 | 9 | |||||
2156 | 199 | |||||
2157 | 2157a | |||||
2163 | 2163a | |||||
2278 | 2278a | |||||
121 | T | 420 | 2 | 1452 | 133 | |
136 | G | 429 | 136a | 1727 | 1727a | |
137 | G | 429 | 8 | 1765 | 72 | |
2094 | 188 | |||||
149 | T, A | 420, 429 | 101 | 1823 | 1223 | |
150 | T, A | 420, 429 | 34 | 1824 | 1824a | |
1848 | 1848a | |||||
1849 | 2198 | |||||
1850 | 1850a | Singleton to CC75 | ||||
2043 | 2043a | |||||
2044 | 2044a | |||||
154 | G | 429 | 18 | 1868 | 89 | |
155 | G | 429 | 2 | 1869 | 30 | |
1952 | 59 | |||||
2012 | 2012a | Singleton to CC522 | ||||
2073 | 121 | |||||
2076 | 2057 | |||||
2077 | 398 | |||||
2080 | 433 | |||||
2095 | 1768 | |||||
2097 | 2097a | Singleton to CC398 | ||||
2098 | 2098a | |||||
2099 | 2099a | |||||
2100 | 2100a | |||||
2161 | 2155 | |||||
2307 | 2307a | |||||
2308 | 2308a | |||||
2348 | 2348a |
New gmk alleles or STs that were unique in the database retained their original allele or ST numbers.