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. 2012 Jul 16;1(7):e20. doi: 10.1038/oncsis.2012.20

Table 1. Sequences of oligonucleotides used for quantitative RT–PCR.

Primer name Forward primer sequence Reverse primer sequence
ETV4 5′-GCTCGCTGAAGCTCAGGT-3′ 5′-TCCTTCTTGATCCTGGTGGT-3′
GAPDH 5′-AACGGATTTGGTCGTATTGGGC-3′ 5′-TTGATTTTGGAGGGATCTCG-3′
TBP 5′-CCACAGCTCTTCCACTCACA-3′ 5′-GCGGTACAATCCCAGAACTC-3′
MMP1 5′-AACTCGGCCATTCTCTTGGA-3′ 5′-TGGCTTGGATGCCATCAAT-3′
MMP2 5′-ACGACCGCGACAAGAAGTAT-3′ 5′-ATTTGTTGCCCAGGAAAGTG-3′
MMP3 5′-ATGCAGAAGTTCCTTGGATTGG-3′ 5′-GATGCCAGGAAAGGTTCTGAAG-3′
MMP7 5′-GCTGGCTCATGCCTTTGC-3′ 5′-TCATGAGTTGCAGCATACAGGAA-3′
MMP9 5′-GGGCTCCCGTCCTGCTT-3′ 5′-CCTCCACTCCTCCCTTTCCT-3′
UPAR 5′-TCTGCAGGACCACGATCGT-3′ 5′-TCTTCAAGCCAGTCCGATAGC-3′
UPA 5′-GATCCCCAGTTTGGCACAAG-3′ 5′-ACACTCCCGGTGGGAAATC-3′
TIMP1 5′-GGGACACCAGAAGTCAACCA-3′ 5′-GGCTTGGAACCCTTTATACATC-3′
TIMP2 5′-CCACCCAGAAGAAGAGCCTGA-3′ 5′-GTGACCCAGTCCATCCAGAG-3′
ADAM9 5′-CAGATGGCAAAAATCAAGCA-3′ 5′-GATGGGAACTGCTGAGGTTG-3′
ADAM10 5′-TCCACAGCCCATTCAGCAA-3′ 5′-AGGCACTAGGAAGAACCAA-3′
ADAM17 5′-TTCACGTTTGCAGTCTCCAA-3′ 5′-ATGTATCTGTAGAAGCGATGATCTG-3′
ADAMTS1 5′-AAGGACAGGTGCAAGCTCAT-3′ 5′-GAGGTGGAATCTGGGCTACA-3′
P27 5′-AATAAGGAAGCGACCTGCAA-3′ 5′-TTCTGAGGCCAGGCTTCTT-3′
p21 5′-CCATGTGGACCTGTCACTGT-3′ 5′-TGGTAGAAATCTGTCATGCTGGTC-3′
MYC 5′-TGCAGCTGCTTAGACGCTGG-3′ 5′-CGAGGTCATAGTTCCTGTTGG-3′
CHEK1 5′-TGGTATTGGAATAACTCACAGGG-3′ 5′-CCGAAATACTGTTGCCAAGCC-3′
MCM7 5′-CGAAGCTCTTTGCTGATGCC-3′ 5′-CCGATGCTCAATGTAAACGTCC-3′
VIM 5′-CGCCATCAACACCGAGTTC-3′ 5′-ATCTTATTCTGCTGCTCCAGGAA-3′
E-cadherin 5′-GAACGCATTGCCACATACAC-3′ 5′-ATTCGGGCTTGTTGTCATTC-3′
N-cadherin 5′-TCAGTGGCGGAGATCCTACT-3′ 5′-GTGCTGAATTCCCTTGGCTA-3′
11-cadherin 5′-CAGCCCGATAAGGTATTCCA-3′ 5′-TGTGGATTTCTGCTGCAAAG-3′
SNAIL1 5′-GCGAGCTGCAGGACTCTAAT-3′ 5′-GGACAGAGTCCCAGATGAGC-3′
SNAIL2 5′-GCCTCCAAAAAGCCAAACTA-3′ 5′-CACAGTGATGGGGCTGTATG-3′
TWIST1 5′-GCCGGAGACCTAGATGTCATT-3′ 5′-CACGCCCTGTTTCTTTGAAT-3′
ZEB1 5′-GCCAATAAGCAAACGATTCTG-3′ 5′-TTTGGCTGGATCACTTTCAAG-3′
ZEB2 5′-AAGCCAGGGACAGATCAGC-3′ 5′-CCACACTCTGTGCATTTGAACT-3′
FOXC2 5′-GCCCAGCAGCAAACTTTCC-3′ 5′-CCGGTGGGAGTTGAACATCT-3′
GSC 5′-AGCAGCTCGAAGCTCTCGAG-3′ 5′-CACGTCCGGGTACTTGGTCT-3′
IL1R2 5′-CTACGCACCACAGTCAAGGAAG-3′ 5′-CGTCTGTGCATCCATATTCCC-3′
SPINT 5′-AGACTACTGCCTCGCATCCAA-3′ 5′-CAAGCAGCCTCCATAAACGAA-3′
KLF8 5′-TCAGAAGGTGGCTCAATGCA-3′ 5′-CCGAACAGAAGCAGTGACCTG-3′
TCF3 5′-AGCTCCTCCTTTGACCCCAG-3′ 5′-ACTCAGTGAAGTGGGTGCCC-3′
TCF4 5′-TGCGATGTTTTCACCTCCTG-3′ 5′-TGCCAAAGAAGTTGGTCCATT-3′
ZO1 5′-GGAGAGGTGTTCCGTGTTGT-3′ 5′-GGCTAGCTGCTCAGCTCTGT-3′
WNT7A 5′-TGTGGCTGCGACAAAGAGAA-3′ 5′-TCCACAAAGACCTTGGCGA-3′
FZD4 5′-TTCACACCGCTCATCCAGTA-3′ 5′-TGCACATTGGCACATAAACA-3′

Abbreviations: RT–PCR, real-time–PCR; GAPDH, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.