Table 1. Isolates used in this study and their subtype identity at the four minisatellite loci.
Isolate ID | Species | Host | Geographic source | MLST subtype | |||
MS1 | MS2 | MS3 | MS16 | ||||
MC2 | C. muris | Siberian chipmunk | Henan | M11 | M4 | M6 | M1 |
MC4 | C. muris | Hamster | Henan | M11 | M4 | M6 | M1 |
MC14 | C. muris | Hamster | Henan | M11 | M4 | M6 | M1 |
MC17 | C. muris | Hamster | Henan | M11 | M4 | M6 | M1 |
OH1 | C. muris | Ostrich | Henan | M5 | M4 | M6 | M4 |
OH2 | C. muris | Ostrich | Henan | M5 | M4 | M6 | M4 |
OH14 | C. muris | Ostrich | Henan | M5 | M4 | M6 | M4 |
OH16 | C. muris | Ostrich | Henan | M5 | M4 | M6 | M4 |
OH18 | C. muris | Ostrich | Henan | M5 | M4 | M6 | M4 |
MC7 | C. andersoni | Hamster | Henan | A3 | A4 | A2 | A2 |
MC16 | C. andersoni | Hamster | Henan | A3 | A4 | A2 | A2 |
CL01 | C. andersoni | Bactrian camel | Henan | A6 | A5 | A2 | A1 |
CL02 | C. andersoni | Bactrian camel | Henan | A6 | A4 | A2 | A1 |
SP69 | C. andersoni | Sheep | Henan | A2 | A5 | A2 | A1 |
SP75 | C. andersoni | Sheep | Henan | A2 | A4 | A2 | A1 |
DY-LB2 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-LB8 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-LY2 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-LY3 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-ZZ7 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A2 | A4 | A2 | A1 |
DY-ZZ8 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-ZZ13 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-ZZ17 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A3 | A4 | A4 | A1 |
DY-ZZ30 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-ZZ31 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A1 | A4 | A4 | A1 |
DY-ZZ47 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A2 | A4 | A2 | A1 |
DY-ZZ48 | C. andersoni | Dairy cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-HLJ3 | C. andersoni | Dairy cattle | Heilongjiang | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-HLJ9 | C. andersoni | Dairy cattle | Heilongjiang | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-HLJ13 | C. andersoni | Dairy cattle | Heilongjiang | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-HLJ14 | C. andersoni | Dairy cattle | Heilongjiang | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-HLJ18 | C. andersoni | Dairy cattle | Heilongjiang | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-JL6-3 | C. andersoni | Dairy cattle | Jilin | Noisy | – | A4 | – |
DY-JL26 | C. andersoni | Dairy cattle | Jilin | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-SC1 | C. andersoni | Dairy cattle | Sichuan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-SC2 | C. andersoni | Dairy cattle | Sichuan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-SC3 | C. andersoni | Dairy cattle | Sichuan | A2 | A4 | A4 | A1 |
DY-SC5 | C. andersoni | Dairy cattle | Sichuan | A1 | A4 | A4 | A1 |
DY-SC6 | C. andersoni | Dairy cattle | Sichuan | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-GX1 | C. andersoni | Dairy cattle | Guangxi | A1 | A4 | A4 | A1 |
DY-GX5 | C. andersoni | Dairy cattle | Guangxi | A1 | A4 | A4 | A1 |
DY-GX6 | C. andersoni | Dairy cattle | Guangxi | A2 | A4 | A2 | A1 |
DY-GX7 | C. andersoni | Dairy cattle | Guangxi | A4 | A4 | A4 | A1 |
DY-SX96 | C. andersoni | Dairy cattle | Shanxi | A4 | A4 | A4 | A1 |
BF-SX00 | C. andersoni | Beef cattle | Shanxi | A4 | A4 | A4 | A1 |
BF-SX13 | C. andersoni | Beef cattle | Shanxi | A4 | A4 | A4 | A1 |
BF-SX23 | C. andersoni | Beef cattle | Shanxi | A4 | A4 | A4 | A1 |
BF-SX101 | C. andersoni | Beef cattle | Shanxi | A4 | A4 | A4 | A1 |
BF39 | C. andersoni | Beef cattle | Henan | A4 | A4 | A4 | A1 |
BF43 | C. andersoni | Beef cattle | Henan | A5 | A4 | A4 | A1 |
BF156 | C. andersoni | Beef cattle | Henan | A1 | A4 | A4 | A1 |
BF160 | C. andersoni | Beef cattle | Henan | A1 | A4 | A4 | A1 |