Table 4.
Performance of individual genes at resolving species within the Colletotrichum gloeosporioides species complex. Y – species distinguished from all others. N – species not distinguished from all others. N* – distinguishes at the subspecies level.
Species | ITS | GAPDH | CAL | TUB2 | ACT | CHS-1 | GS | SOD |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C. fructicola | N | N | Y | N | N | Y | Y | Y |
C. nupharicola | N | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. alienum | N | N | Y | N | N | Y | Y | Y |
C. musae | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. aenigma | N | Y | Y | Y | N | Y | Y | Y |
C. siamense | N | N | Y | Y | N | N | N | N |
C. aeschynomenes | N | N | N | Y | N | Y | Y | Y |
C. tropicale | N | N | N | Y | Y | N | Y | Y |
C. queenslandicum | N | Y | Y | Y | N | N | Y | N |
C. salsolae | N | Y | Y | Y | Y | Y | N | Y |
C. asianum | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. gloeosporioides | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. alatae | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. theobromicola | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. xanthorrhoeae | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. horii | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
C. aotearoa | N | N | Y | Y | N | Y | Y | N |
C. ti | N | Y | Y | Y | N | Y | Y | Y |
C. kahawae | N | Y | N | Y | Y | N | N* | N |
G. cingulata “f. sp. camelliae” | Y | N | Y | Y | Y | N | Y | Y |
C. clidemiae | N | N | N | N | Y | Y | Y | N |
C. psidii | Y | Y | Y | Y | N | Y | Y | Y |
C. cordylinicola | Y | Y | Y | Y | N | Y | Y | Y |