Table 3.
field isolate (LGL strain number) |
MALDI-TOF MS |
gene sequencing (16S rRNA) | |
---|---|---|---|
first match | score value | ||
L. interrogans Canicola (87) |
L. interrogans Hebdomadis |
2.62 |
L. interrogans |
L. interrogans Bratislava (538) |
L. interrogans Bratislava |
2.37 |
L. interrogans |
L. interrogans Bratislava (540) |
L. interrogans Autumnalis |
2.46 |
L. interrogans |
L. interrogans Australis (537) |
L. interrogans Hardjo |
2.54 |
L. interrogans |
L. interrogans Icterohaemorrhagiae (113) |
L. interrogans Icterohaemorrhagiae |
2.67 |
L. interrogans |
L. interrogans Icterohaemorrhagiae (471) |
L. interrogans Icterohaemorrhagiae |
2.54 |
L. interrogans |
L. interrogans Icterohaemorrhagiae (535) |
L. interrogans Icterohaemorrhagiae |
5.57 |
L. interrogans |
L. kirschneri Grippotyphosa a (518) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.18 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Grippotyphosa a (518) |
L. interrogans Canicola |
2.18 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Grippotyphosa (517) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.38 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Grippotyphosa (533) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.09 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Grippotyphosa (541) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.13 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Grippotyphosa (112) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.54 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Grippotyphosa (539) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.17 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Pomona (532) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.28 |
L. kirschneri |
L. kirschneri Pomona (511) |
L. kirschneri Grippotyphosa |
2.34 |
L. kirschneri |
L. borgpetersenii Saxkoebing (489) | L. borgpetersenii Saxkoebing | 2.49 | L. borgpetersenii |
The table pictures the most reliable identification of the field isolates with the established MSP database and lists the achieved score values.
aL. kirschneri isolate that matched with the reference strain of L. interrogans as well as with L. kirschneri at first place.