Skip to main content
. Author manuscript; available in PMC: 2013 Apr 1.
Published in final edited form as: Gene. 2012 Jan 25;496(2):118–127. doi: 10.1016/j.gene.2012.01.006

Table 1.

Primers used to make deletion constructs.

Primer name Sequence (5′-3′) Plasmid
CS11fow GCTTACTTTCATAATTGCTTTTGATTTTAACGACTTTTAACG pCSΔ94-73
CS11rev CGTTAAAAGTCGTTAAAATCAAAAGCAATTATGAAAGTAAGC
CS12fow GCTTACTTTCATAATTGCCGACAACTTGAGAAGATCAAAAAAC pCSΔ94-51
CS12rev GTTTTTTGATCTTCTCAAGTTGTCGGCAATTATGAAAGTAAGC
CS13fow GCTTACTTTCATAATTGCAAAAAACAACTAATTATTCGAAACGAGG pCSΔ94-33
CS13rev CCTCGTTTCGAATAATTAGTTGTTTTTTGCAATTATGAAAGTAAGC
CS14fow GCTTACTTTCATAATTGCCGAAACGAGGAATTCATGCCAGGGG pCSΔ94-16
CS14rev CCCCTGGCATGAATTCCTCGTTTCGGCAATTATGAAAGTAAGC
CS15fow CTTTTTTTTTATCATCATTATTAGCCGAAACGAGGAATTCATGCCAGGGG pCSΔ110-16
CS15rev CCCCTGGCATGAATTCCTCGTTTCGGCTAATAATGATGATAAAAAAAAAG
CS25fow GCTTACTTTCATAATTGCGATTTTAACGACTTTTAACGAC pCSΔ94-69
CS25rev GTCGTTAAAAGTCGTTAAAATCGCAATTATGAAAGTAAGC
CS30fow GCTTACTTTCATAATTGCTAACGACTTTTAACGAC pCSΔ94-64
CS30rev GTCGTTAAAAGTCGTTAGCAATTATGAAAGTAAGC
AMYAOX5UTRdel5TOP GGTTCCAATTGACAAGCATTTTAACGAC pCSΔ69-73
AMYAOX5UTRdel5BOTTOM GTCGTTAAAATGCTTGTCAATTGGAACC
AMYAOX5UTRdel9TOP GCGACTGGTTCCAATTGACAATTTAACGACTTTTAACG pCSΔ67-75
AMYAOX5UTRdel9BOTTOM CGTTAAAAGTCGTTAAATTGTCAATTGGAACCAGTCGC
PAH15top CTAGTAGCTTACTTTCATAATTGCACA pCSΔ94-80
PAH15bottom AGCTTGTGCAATTATGAAAGTAAGCTA
TM31-43TOP GACAAGCTTTTGATTTCGACAACTTGAGAAG pCSΔ63-51
TM31-43BOT CTTCTCAAGTTGTCGAAATCAAAAGCTTGTC
MN62-79TOP CAACTTGAGAAGATCCGAAACGAGGAATTC pCSΔ32-16
MN62-79BOT GAATTCCTCGTTTCGGATCTTCTCAAGTTG
KO74-86TOP GATCAAAAAACAACTAATAGGAATTCATGCCAG pCSΔ9-19
KO74-86BOT CTGGCATGAATTCCTATTAGTTGTTTTTTGATC
MNKOTM25-28DELBOT CGTTAAAAGTCGTTAAAAAAGCTTGTCAATTGG pCSΔ67-70
MNKOTM25-28DELTOP CCAATTGACAAGCTTTTTTAACGACTTTTAACG
MNKOTM66-73DELTOP CTTGAGAAGATCAAAAATTATTCGAAACGAGG pCSΔ22-29
MNKOTM66-73DELBOT CCTCGTTTCGAATAATTTTTGATCTTCTCAAG