Table 1.
List of taxa included in the study
| Species | Origin of sample | Voucher number | GAPDH | ODC | ND3 | ND2 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
Corvus albicollis |
South Africa |
FMNH 447947 |
|
JQ024104 |
JQ024061 |
JQ023991 |
|
Corvus albus |
South Africa |
FMNH 443790 |
JQ023921 |
JQ024103 |
JQ024060 |
JQ023990 |
|
Corvus bennetti |
Australia |
ANWC 33292 |
JQ023900 |
JQ024082 |
JQ024019 |
JQ023945 |
|
Corvus bennetti |
Australia |
ANWC 52018 |
JQ023901 |
JQ024083 |
JQ024020 |
JQ023946 |
|
Corvus brachyrhynchos |
USA |
UWBM 86268 |
JQ023920 |
JQ024102 |
JQ024039 |
JQ023966 |
|
Corvus capensis* |
Abyssinia |
FMNH 370464 |
|
|
|
JQ023977 |
|
Corvus caurinus |
USA |
UWBM 58841 |
JQ023915 |
JQ024097 |
JQ024034 |
JQ023961 |
|
Corvus corax |
Denmark |
ZMUC 131662 |
JQ023891 |
JQ024073 |
|
JQ023935 |
|
Corvus corone cornix |
Denmark |
ZMUC 143486 |
JQ023894 |
JQ024076 |
JQ024013 |
JQ023939 |
|
Corvus corone corone |
Denmark |
ZMUC 138386 |
JQ023892 |
JQ024074 |
JQ024010 |
JQ023936 |
|
Corvus coronoides coronoides |
Australia, QLD |
ANWC 32675 |
JQ023908 |
JQ024090 |
JQ024027 |
JQ023953 |
|
Corvus coronoides coronoides |
Australia, NSW |
ANWC 49539 |
JQ023911 |
JQ024093 |
JQ024030 |
JQ023956 |
|
Corvus coronoides coronoides |
Australia, NSW |
ANWC 29239 |
JQ023904 |
JQ024086 |
JQ024023 |
JQ023949 |
|
Corvus coronoides coronoides |
Australia, ACT |
ANWC 34200 |
JQ023910 |
JQ024092 |
JQ024029 |
JQ023955 |
|
Corvus coronoides perplexus |
Australia, WA |
ANWC 31774 |
JQ023906 |
JQ024088 |
JQ024025 |
JQ023951 |
|
Corvus coronoides perplexus |
Australia, WA |
ANWC 31706 |
JQ023905 |
JQ024087 |
JQ024024 |
JQ023950 |
|
Corvus coronoides perplexus |
Australia, WA |
ANWC 50365 |
JQ023902 |
JQ024084 |
JQ024021 |
JQ023947 |
|
Corvus coronoides perplexus |
Australia, WA |
ANWC 31869 |
JQ023907 |
JQ024089 |
JQ024026 |
JQ023952 |
|
Corvus coronoides perplexus |
Australia, WA |
ANWC 50476 |
JQ023912 |
JQ024094 |
JQ024031 |
JQ023957 |
|
Corvus crassirostris* |
Ethiopia |
NRM 551730 |
|
|
JQ024002 |
JQ023927 |
|
Corvus cryptoleucus |
USA |
UWBM 80762 |
JQ023917 |
JQ024099 |
JQ024036 |
JQ023963 |
|
Corvus dauuricus |
Mongolia |
UWBM 58041 |
JQ023913 |
JQ024095 |
JQ024032 |
JQ023958 |
|
Corvus edithae* |
Kenya |
FMNH 370461 |
|
|
JQ024056 |
JQ023986 |
|
Corvus enca celebensis* |
Sulawesi |
RMNH 60561 |
|
|
JQ024042 |
JQ023969 |
|
Corvus enca compilator* |
Borneo |
RMNH 60563 |
|
|
JQ024059 |
JQ023989 |
|
Corvus enca pusillus* |
Palawan |
RMNH 100023 |
|
|
JQ024043 |
JQ023970 |
|
Corvus florensis* |
Flores |
RMNH 85140 |
|
|
JQ024046 |
JQ023973 |
|
Corvus frugilegus frugilegus |
Denmark |
ZMUC 143511 |
|
|
JQ024011 |
JQ023937 |
|
Corvus frugilegus pastinator* |
China |
NRM 570731 |
|
|
JQ024068 |
JQ023999 |
|
Corvus fuscicapillus* |
New Guinea |
AMNH 300970 |
|
|
JQ024048 |
JQ023975 |
|
Corvus hawaiiensis* |
Hawaii |
AMNH 196263 |
|
|
|
JQ023982 |
|
Corvus imparatus* |
Mexico |
AMNH 706673 |
|
|
|
JQ023978 |
| Corvus insularis |
New Britain |
AM 0.60592 |
JQ023888 |
JQ024070 |
JQ024007 |
JQ023932 |
|
Corvus jamaicensis* |
Jamaica |
AMNH 155238 |
|
|
JQ024052 |
JQ023981 |
|
Corvus kubaryi* |
Micronesia |
NRM 570711 |
|
|
JQ024003 |
JQ023928 |
|
Corvus leucognaphalus* |
Hispaniola |
NRM 570710 |
|
|
JQ024004 |
JQ023929 |
|
Corvus macrorhynchos japonensis* |
Japan |
NRM 570732 |
|
|
JQ024069 |
JQ024000 |
|
Corvus macrorhynchos levaillantii* |
N. Siam |
NRM 570733 |
|
|
JQ024067 |
JQ023998 |
|
Corvus macrorhynchos mandschuricus |
Russia |
UWBM 47167 |
JQ023918 |
JQ024100 |
JQ024037 |
JQ023964 |
|
Corvus macrorhynchos philippinus* |
Philippines |
ZMUC 104586 |
|
|
JQ024054 |
JQ023984 |
|
Corvus meeki* |
Bougainville |
AMNH 221033 |
|
|
JQ024058 |
JQ023988 |
|
Corvus mellori |
Australia |
ANWC 45128 |
JQ023895 |
JQ024077 |
JQ024014 |
JQ023940 |
|
Corvus mellori |
Australia |
ANWC 52403 |
JQ023903 |
JQ024085 |
JQ024022 |
JQ023948 |
|
Corvus mellori |
Australia |
ANWC 34099 |
JQ023909 |
JQ024091 |
JQ024028 |
JQ023954 |
|
Corvus minutus* |
Cuba |
AMNH 501484 |
|
|
JQ024051 |
JQ023980 |
|
Corvus monedula |
Denmark |
ZMUC 143533 |
JQ023893 |
JQ024075 |
JQ024012 |
JQ023938 |
|
Corvus moneduloides* |
New Caledonia |
FMNH 268468 |
|
|
JQ024040 |
JQ023967 |
| Corvus nasicus* |
Cuba |
NRM 570734 |
|
|
JQ024066 |
JQ023997 |
|
Corvus orru |
Australia |
ANWC 32239 |
JQ023898 |
JQ024080 |
JQ024017 |
JQ023943 |
|
Corvus orru |
Australia |
ANWC 50885 |
JQ023899 |
JQ024081 |
JQ024018 |
JQ023944 |
|
Corvus ossifragus |
USA |
UWBM 86680 |
JQ023914 |
JQ024096 |
JQ024033 |
JQ023960 |
|
Corvus palmarum* |
Hispaniola |
FMNH 352731 |
|
|
JQ024050 |
JQ023979 |
|
Corvus palmarum |
Hispaniola |
AMNH DOT 16134 |
JQ023922 |
JQ024105 |
|
JQ023992 |
|
Corvus pectoralis* |
China |
AMNH 261595 |
|
|
JQ024053 |
JQ023983 |
|
Corvus pectoralis* |
China |
NRM 570709 |
|
|
JQ024005 |
JQ023930 |
|
Corvus rhipidurus* |
Niger |
FMNH370467 |
|
|
JQ024057 |
JQ023987 |
|
Corvus ruficollis* |
Iran |
FMNH284717 |
|
|
JQ024055 |
JQ023985 |
|
Corvus sinaloae |
Mexico |
UWBM 81200 |
JQ023916 |
JQ024098 |
JQ024035 |
JQ023962 |
|
Corvus splendens |
Singapore |
UWBM 83598 |
JQ023919 |
JQ024101 |
JQ024038 |
JQ023965 |
|
Corvus tasmanicus boreus |
Australia |
AM 0.70670 |
JQ023889 |
JQ024071 |
JQ024009 |
JQ023934 |
|
Corvus tasmanicus boreus |
Australia |
AM 0.70687 |
JQ023890 |
JQ024072 |
JQ024008 |
JQ023933 |
|
Corvus tasmanicus tasmanicus |
Australia |
ANWC 44920 |
JQ023896 |
JQ024078 |
JQ024015 |
JQ023941 |
|
Corvus tasmanicus tasmanicus |
Australia |
ANWC 45502 |
JQ023897 |
JQ024079 |
JQ024016 |
JQ023942 |
|
Corvus tristis* |
New Guinea |
NRM 543594 |
|
|
JQ024006 |
JQ023931 |
|
Corvus tristis* |
New Guinea |
RMNH 22732 |
|
|
JQ024049 |
JQ023976 |
|
Corvus typicus* |
Sulawesi |
RMNH 101686 |
|
|
JQ024045 |
JQ023972 |
|
Corvus unicolor* |
Sulawesi |
AMNH 673967 |
|
|
JQ024041 |
JQ023968 |
|
Corvus validus* |
Halmahera |
RMNH 140643 |
|
|
JQ024047 |
JQ023974 |
|
Corvus violaceus* |
Seram |
RMNH 140590 |
|
|
JQ024044 |
JQ023971 |
|
Corvus woodfordi |
Solomon Islands |
UWBM 63090 |
|
|
|
JQ023959 |
|
Corvus woodfordi |
Solomon Islands |
AMNH DOT6705 |
JQ023923 |
JQ024106 |
JQ024062 |
JQ023993 |
|
Outgroups |
|
|
|
|
|
|
|
Nucifraga caryocatactes |
Sweden |
ZMUC 138408 |
JQ023924 |
JQ024107 |
JQ024064 |
JQ023995 |
|
Garrulus garrulus |
Denmark |
ZMUC 136378 |
|
|
JQ024063 |
JQ023994 |
|
Pica pica |
Denmark |
ZMUC 144204 |
JQ023925 |
JQ024108 |
JQ024065 |
JQ023996 |
|
Lanius collaris |
Cameroon/Tanzania |
GenBank/ZMUC 138905 |
FJ357916 |
EU272112 |
JQ024001 |
JQ023926 |
|
Dicrurus bracteatus/hottentottus |
New Guinea/Philippines |
GenBank |
EF052813 |
EU272113 |
GQ145422 |
GQ145384 |
|
Sturnus vulgaris |
Sweden |
GenBank |
EF441231 |
EF441253 |
GU816823 |
DQ146346 |
|
Menura |
Australia |
GenBank |
EF441220 |
EF441242 |
AY542313 |
AY542313 |
|
Pitta angolensis |
Tanzania |
GenBank |
AY336596 |
DQ785940 |
GU816799 |
GU816827 |
| Acanthisitta | New Zealand | GenBank | EU726202 | EU726220 | AY325307 | AY325307 |
Acronyms are: AM, Australian Museum, Sydney, Australia; AMNH, American Museum of Natural History, USA; ANWC, Australian National Wildlife Collection, Canberra, Australia; FMNH, Field Museum of Natural History, Chicago, USA; NRM, Naturhistoriska Riksmuseet, Stockholm, Sweden; RMNH, Rijksmuseum van Natuurlijke Histoire, Leiden, Netherlands; UWBM, University of Washington, Burke Museum, Seattle, USA; ZMUC, Zoological Museum, University of Copenhagen, Denmark. Asterisks after taxon names indicate that sequences were obtained from toe-pads of old museum specimens.