Table 4.
Sequence positions | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Haplotypes |
3 |
5 |
7 |
9 |
1 |
1 |
1 |
2 |
2 |
3 |
3 |
3 |
3 |
4 |
4 |
5 |
5 |
6 |
0 |
8 |
9 |
7 |
6 |
6 |
7 |
0 |
0 |
2 |
3 |
5 |
9 |
3 |
8 |
2 |
8 |
1 |
|
3 | 4 | 2 | 4 | 8 | 6 | 7 | 8 | 1 | 6 | 1 | 0 | 6 | 9 | |||||
H1 |
C |
C |
C |
C |
T |
G |
T |
G |
A |
G |
A |
C |
C |
A |
C |
A |
C |
G |
H2 |
• |
T |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
G |
|
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H3 |
• |
• |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
H4 |
• |
T |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H5 |
• |
T |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
A |
H6 |
• |
• |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
T |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
H7 |
• |
T |
• |
• |
C |
A |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H8 |
• |
T |
• |
• |
C |
• |
• |
T |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H9 |
• |
• |
• |
• |
C |
• |
C |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H10 |
• |
T |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
|
• |
• |
G |
T |
• |
T |
• |
H11 |
T |
• |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
T |
• |
• |
• |
• |
• |
H12 |
• |
T |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
C |
T |
• |
H13 |
• |
• |
T |
• |
C |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H14 |
• |
T |
• |
T |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H15 |
T |
• |
• |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
H16 |
• |
• |
• |
• |
C |
• |
C |
• |
• |
• |
• |
• |
• |
G |
• |
• |
T |
• |
H17 | • | T | • | • | C | • | • | • | • | A | • | • | G | • | • | T | • |
The number at the top indicates polymorphic sites, and dots represent nucleotide variants identical to the first sequence.