Skip to main content
. 2012 Nov 15;6(11):e1906. doi: 10.1371/journal.pntd.0001906

Table 1. Allele frequencies at 12 loci in O. viverrini from Khon Kaen and widely spaced populations.

Locus Allele (bp) Khon Kaen populations Widely spaced populations
KBs KLp KBp KPv LP BR CP NP VT
Ovms1 269 0.091 0.143 0.250 0.224 0.300 0.167 0.167 0.194 0.211
271 0.205 0.143 0.136 0.224 0.075 0.111 0.119 0.194 0.158
273 0.409 0.500 0.250 0.276 0.175 0.417 0.333 0.333 0.290
275 0.136 0.143 0.045 0.190 0.300 0.167 0.149 0.111 0.158
277 0.114 0.071 0.205 0.069 0.100 0.056 0.095 0.056 0.105
279 0.023 0.000 0.068 0.000 0.000 0.028 0.024 0.056 0.053
281 0.023 0.000 0.023 0.000 0.050 0.056 0.071 0.056 0.026
283 0.000 0.000 0.023 0.017 0.000 0.000 0.048 0.000 0.000
Ovms2 365 0.000 0.059 0.043 0.026 - - - - -
367 0.167 0.118 0.000 0.000 0.000 0.068 0.105 0.000 0.000
369 0.500 0.324 0.543 0.421 0.452 0.455 0.553 0.705 0.617
371 0.000 0.029 0.065 0.000 0.000 0.046 0.026 0.000 0.017
373 0.000 0.000 0.065 0.000 0.071 0.136 0.000 0.000 0.000
375 - - - - 0.000 0.023 0.000 0.000 0.000
377 - - - - 0.000 0.000 0.053 0.000 0.000
379 0.000 0.088 0.043 0.132 0.048 0.000 0.079 0.023 0.033
381 0.167 0.147 0.087 0.184 0.167 0.114 0.000 0.068 0.067
383 0.167 0.088 0.000 0.079 0.024 0.068 0.132 0.068 0.050
385 0.000 0.000 0.065 0.053 0.048 0.046 0.000 0.000 0.150
387 0.000 0.059 0.000 0.000 0.071 0.000 0.026 0.046 0.000
389 0.000 0.088 0.087 0.053 0.024 0.000 0.000 0.091 0.033
391 - - - - 0.048 0.046 0.026 0.000 0.000
393 - - - - 0.000 0.000 0.000 0.000 0.033
395 0.000 0.000 0.000 0.053 0.048 0.000 0.000 0.000 0.000
Ovms5 236 0.000 0.019 0.033 0.000 0.000 0.000 0.017 0.000 0.000
240 1.000 0.981 0.967 1.000 1.000 1.000 0.983 1.000 1.000
Ovms6 344 0.000 0.037 0.000 0.000 - - - - -
346 0.040 0.148 0.067 0.121 0.000 0.143 0.052 0.035 0.054
348 0.380 0.204 0.433 0.362 0.750 0.482 0.535 0.397 0.446
350 0.140 0.315 0.300 0.241 0.250 0.179 0.259 0.086 0.304
352 0.440 0.296 0.200 0.276 0.000 0.179 0.155 0.448 0.179
354 - - - - 0.000 0.000 0.000 0.000 0.018
356 - - - - 0.000 0.018 0.000 0.000 0.000
358 - - - - 0.000 0.000 0.000 0.035 0.000
Ovms10 157 0.000 0.000 0.000 0.033 0.000 0.017 0.000 0.000 0.000
159 0.033 0.000 0.000 0.083 0.033 0.100 0.000 0.000 0.000
161 0.567 0.333 0.017 0.550 0.617 0.617 0.417 0.433 0.717
163 0.400 0.667 0.983 0.333 0.350 0.267 0.567 0.567 0.283
165 - - - - 0.000 0.000 0.017 0.000 0.000
Ovms11 255 1.000 1.000 1.000 0.967 0.950 0.917 0.950 1.000 1.000
258 0.000 0.000 0.000 0.033 0.050 0.083 0.050 0.000 0.000
Ovms12 223 0.000 0.125 0.117 - 0.500 0.000 0.000 0.000 0.000
225 1.000 0.875 0.883 - 0.500 1.000 1.000 1.000 1.000
Ovms13 222 0.237 0.321 0.483 0.431 0.517 0.367 0.517 0.483 0.533
224 0.763 0.679 0.517 0.569 0.483 0.633 0.483 0.517 0.467
Ovms14 160 0.000 0.000 0.023 0.000 - 0.000 0.040 0.000 0.000
162 0.052 0.036 0.091 0.000 - 0.138 0.000 0.125 0.000
164 0.948 0.964 0.886 1.000 - 0.862 0.940 0.875 1.000
164 - - - - - 0.000 0.020 0.000 0.000
Ovms15 177 0.321 0.414 0.350 0.397 0.150 0.030 0.483 0.583 0.405
179 0.607 0.500 0.583 0.466 0.783 0.483 0.433 0.300 0.476
181 0.071 0.052 0.017 0.017 0.033 0.050 0.050 0.050 0.048
183 0.000 0.017 0.033 0.069 0.017 0.050 0.000 0.067 0.071
185 0.000 0.017 0.017 0.052 0.017 0.083 0.000 0.000 0.000
191 - - - - 0.000 0.033 0.033 0.000 0.000
Ovms16 205 - - - - 0.000 0.000 0.029 0.000 0.000
207 0.083 0.000 0.143 - 0.000 0.200 0.029 0.000 0.000
209 0.417 0.208 0.286 - 0.204 0.300 0.294 0.658 0.500
211 0.500 0.792 0.571 - 0.759 0.500 0.647 0.342 0.500
213 - - - - 0.037 0.000 0.000 0.000 0.000
Ovms17 205 0.083 0.133 0.200 0.167 0.168 0.103 0.117 0.183 0.150
207 0.717 0.783 0.633 0.767 0.650 0.603 0.717 0.750 0.617
209 0.200 0.083 0.150 0.050 0.167 0.276 0.150 0.067 0.233
211 0.000 0.000 0.017 0.017 0.017 0.017 0.017 0.000 0.000

Sampling localities for the Khon Kaen populations were Ban Sa-ard (KBs), Ban Lerngpluey (KLp), Ban Phai (KBp), Phu Wiang (KPv) and for the widely spaced populations were Lampang (LP), Buri Rum (BR), Chaiya Phum (CP), Nakhon hanom (NP) and Vientiane (VT). See also Figure 1.