Table 2.

Difference confirmation by sanger sequencing

somatic variations	missense	MLL:NM_005933	P-TU	het C/T	H-STS	het C/T	L-STS	het C/T
		cC11305T (H3769V)	P-STS P14	het C/T	H-STS P7	het C/T	L-STS P9	hom C (wt)
			P-STS P41	het C/T	H-STS P42	hom C (wt)	L-STS P49	hom C (wt)
		BRCA2: NM_000059	P-TU	het C/T	H-STS	het C/T	L-STS	het C/T
		cC1783T (H595Y)	P-STS P14	het C/T	H-STS P7	het C/T	L-STS P9	hom C (wt)
			P-STS P41	het C/T	H-STS P42	hom C (wt)	L-STS P49	hom C (wt)
		ERCC5: NM_000123	P-TU	het T/C	H-STS	het T/C	L-STS	het C/T
		cT266C (V89A)	P-STS P14	het T/C	H-STS P7	het T/C	L-STS P9	hom T (wt)
			P-STS P41	het T/C	H-STS P42	hom T (wt)	L-STS P49	hom T (wt)
		KIT: NM_000222	P-TU	het A/C	H-STS	het A/C	L-STS	het A/C
		cA1606C (M536L)	P-STS P14	het A/C	H-STS P7	het A/C	L-STS P9	hom A (wt)
			P-STS P41	het A/C	H-STS P42	hom A (wt)	L-STS P49	hom A (wt)
		TP53: NM_000546	P-TU	het C/T	H-STS	het C/T	L-STS	het C/T
		cC817T (R273C)	P-STS P14	het C/T	H-STS P7	het C/T	L-STS P9	hom C (wt)
			P-STS P41	het C/T	H-STS P42	hom C (wt)	L-STS P49	hom C (wt)
		SMAD4: NM_005359	P-TU	het G/A	H-STS	het G/A	L-STS	het G/A
		cG290A (R97H)	P-STS P14	het G/A	H-STS P7	het G/A	L-STS P9	hom G (wt)
			P-STS P41	het G/A	H-STS P42	hom G (wt)	L-STS P49	hom G (wt)
		ROS1: NM_002944	P-TU	het G/A	H-STS	het G/A	L-STS	het G/A
			P-STS P14	het G/A	H-STS P7	het G/A	L-STS P9	hom G (wt)
			P-STS P41	het G/A	H-STS P42	hom G (wt)	L-STS P49	hom G (wt)
	frame shift	HNF1A: NM_00545.4	P-TU	het C ins		het C ins	L-STS	het C ins
			P-STS P14	het C ins		het C ins	L-STS P9	wt
			P-STS P41	het C ins		wt	L-STS P49	wt
		CTBBB1: NM_001098209.1	P-TU	het GTT del	H-STS	het GTT del	L-STS	het GTT del
			P-STS P14	het GTT del	H-STS P7	het GTT del	L-STS P9	wt
			P-STS P41	hom GTT del	H-STS P42	wt	L-STS P49	wt
germline transmited variants	SNP	HNF1A: NM_000545.4	P-TU	hom C	H-STS	hom C	L-STS	hom C
		cG864C (G288G)	P-STS P14	hom C	H-STS P7	hom C	L-STS P9	hom C
		rs 56348580	P-STS P41	hom C	H-STS P42	hom C	L-STS P49	hom C
		TP53: NM_000546	P-TU	het C/G	H-STS	het C/G	L-STS	het C/G
		cC215G (P72R)	P-STS P14	het C/G	H-STS P7	het C/G	L-STS P9	het C/G
			P-STS P41	homG	H-STS P42	het C/G	L-STS P49	het C/G
		KIAA1549: NM_001164665.1	P-TU	homG	H-STS	homG	L-STS	homG
		cA1090G (T364A)	P-STS P14	homG	H-STS P7	homG	L-STS P9	homG
		rs59985563	P-STS P41	homG	H-STS P42	homG	L-STS P49	homG
		KIAA1549: NM_001164665.1	P-TU	homG	H-STS	homG	L-STS	homG
		cC1940G (S647C)	P-STS P14	homG	H-STS P7	homG	L-STS P9	homG
		rs61734132	P-STS P41	homG	H-STS P42	homG	L-STS P49	homG
	missense	SDHB: NM_003000.2	P-TU	het C/T	H-STS	het C/T	L-STS	het C/T
		cC98T (A33L)	P-STS P14	het C/T	H-STS P7	het C/T	L-STS P9	het C/T
			P-STS P41	het C/T	H-STS P42	het C/T	L-STS P49	het C/T
		NOTCH1: NM_017617.3	P-TU	het G/T	H-STS	het G/T	L-STS	het G/T
		cG5457T (E1818D)	P-STS P14	het G/T	H-STS P7	het G/T	L-STS P9	het G/T
			P-STS P41	het G/T	H-STS P42	het G/T	L-STS P49	het G/T
		MYC: NM_002467.4	P-TU	het T/C	H-STS	het T/C	L-STS	het T/C
		cT64C (F22L)	P-STS P14	het T/C	H-STS P7	het T/C	L-STS P9	het T/C
			P-STS P41	het T/C	H-STS P42	het T/C	L-STS P49	het T/C

Sequencing results as determined for the selected missense, frame-shift and SNPs variants in the primary tumor (P-TU), the metastatic tissues (H-STS and L-STS) and early and late passages of the respective tissue-derived cell lines. Het: heterozygous genotype; Hom: homozygous genotype; wt: wild-type e.g. same seq. information as observed for blood DNA.