Table 1. Results of FISH experiments and nested-PCR assays on Niphargus individuals.
Niphargus individuals | FISH results | PCR results | ||||||||
Species | Cave | Year | Individuals | # of individuals harboring | Individuals | # of individuals | ||||
analyzed | filaments that bound to | analyzed | containing | |||||||
(n) | NSPT1 | NSPT2 | NSPT3 | (n) | T1 | T2 | T3 | |||
Niphargus | GS | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 4 | 4 | 3 | 4 |
frasassianus | 2009 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | |
ST | 2009 | 2 | 2 | 0 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | |
2010 | 6 | 6 | 0 | 6 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | ||
GB | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 3 | 3 | 3 | 3 | |
2009 | 1 | 1 | 0 | 1 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | ||
PC | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 1 | 1 | 1 | 1 | |
2009 | 3 | 3 | 0 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 | ||
RS | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 3 | 3 | 3 | 3 | |
2009 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 4 | 4 | 4 | 4 | ||
Niphargus | BG | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 2 | 0 | 2 | 2 |
ictus | 2011 | 2 | 0 | 2 | 2 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | |
LV | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 4 | 0 | 4 | 4 | |
2009 | 1 | 0 | 1 | 0 | 2 | 0 | 2 | 1 | ||
2010 | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | ||
2011 | 6 | 0 | 6 | 0 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | ||
PC | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 3 | 2 | 3 | 3 | |
2009 | 2 | 0 | 2 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | ||
RS | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 2 | 1 | 2 | 2 | |
LC | 2009 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 1 | 0 | 1 | 1 | |
Niphargus | BG | 2008 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | 5 | 2 | 5 | 5 |
montanarius | 2010 | 6 | 0 | 6 | 6 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. | |
2011 | 1 | 0 | 1 | 1 | 0 | n.a. | n.a. | n.a. |
NSPT1–NSPT3 = Niphargus Symbiont Probes specific to Thiothrix clades T1–T3. GS = Grotta Sulfurea, ST = Sorgente del Tunnel, GB = Grotta Bella, PC = Pozzo dei Cristalli, RS = Ramo Sulfureo, BG = Il Bugianardo, LV = Lago Verde, LC = Lago Claudia. n.a. = not analyzed.