Table 1.

Comparison of hsp65 RFLP, rpo B RFLP patterns, 16 S rDNA sequences and conventional biochemical identification in 361 isolates with concordant results

rpo B RFLP pattern	hsp65 RFLP pattern	16 S rDNA sequence identification	Conventional biochemical	BACTEC culture number	Concordance rate
			identification
T	M. tuberculosis type 1	M. tuberculosis	M. tuberculosis	200	100%(200/200)
	NTM	NTM	NTM	161	91.4%(161/176)
A	M. abscessus type1	M. abscessus	M. abscessus	29
A	M. abscessus type 2	M. abscessus	M. abscessus	41
A	M. fortuitum type 1	M. fortuitum	M. fortuitum	33
A	M. fortuitum type 2	M. fortuitum	M. fortuitum	2
A	M. peregrinum type 1	M. peregrinum	M. fortuitum*	5
A	M. peregrinum type 2	M. peregrinum	M. fortuitum*	8
A	M. peregrinum type 3	M. peregrinum	M. fortuitum*	1
A	M. chelonae type 1	M. chelonae	M. chelonae	1
A	M. mucogenicum type 1	M. mucogenicum	M. mucogenicum	2
A	M. smegmatis type 1	M. smegmatis	M. smegmatis	2
B	M. avium subsp. avium type 2	M. avium subsp. avium	M. avium complex**	2
D	M. kansasii type 1	M. kansasii	M. kansasii	6
D	M. kansasii type 2	M. kansasii	M. kansasii	1
D	M. kansasii type 6	M. kansasii	M. kansasii	1
D	M. triviale type 1	M. triviale	M. triviale	1
F	M. malmoense type 1	M. malmoense	M. malmoense	2
F	M. szulgai type 1	M. szulgai	M. szulgai	1
F	M. interjectum type 1	M. interjectum	M. interjectum	1
G	M. intracellulare type 1	M. intracellulare	M. avium complex**	14
G	M. gordonae type 1	M. gordonae	M. gordonae	6
G	M. gordonae type 2	M. gordonae	M. gordonae	1
G	M. gordonae type 5	M. gordonae	M. gordonae	1
Total				361

* M. peregrinum was identified as M. fortuitum by a conventional biochemical method.

**M. avium subsp. avium and M. intracellulare were identified as M. avium complex by a conventional biochemical method.