Table 2.
Fifteen isolates of NTM species with discordant results fromrpoB RFLP,hsp65RFLP patterns, 16 S rDNA sequence and conventional biochemical identification
|
No |
rpo B RFLP pattern |
hsp65 RFLP pattern |
16 S rDNA sequence |
Conventional biochemical identification |
|
1 |
A |
BstEII : 242.8*, 214.0, 0 |
M. flavescens |
M. flavescens |
| |
|
HaeIII: 130.9, 140, 90.4, 49.7, 41.5, 37.1 |
|
|
|
2 |
A |
BstEII :456.3, 0, 0 |
Mycobacterial species |
M. mucogenicum |
| |
|
HaeIII:192.6, 90.4, 82.0 |
|
|
|
3 |
D |
M. scrofulaceum type 1 |
M. scrofulaceum |
M. scrofulaceum |
|
4 |
G |
M. simiae type 5 |
M. simiae |
M. simiae |
|
5 |
G |
M. simiae type 5 |
M. simiae |
M. simiae |
|
6 |
F |
M. intracellulare type 3 |
M. intracellulare |
M. avium complex** |
|
7 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
8 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
9 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
10 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
11 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
12 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
13 |
F |
M. gordonae type 3 |
M. gordonae |
M. gordonae |
|
14 |
F |
M. gordonae type 4 |
M. gordonae |
M. gordonae |
| 15 | F | M. gordonae type 4 | M. gordonae | M. gordonae |