Skip to main content
. 2004 May 1;1(4):255–273. doi: 10.1186/1479-7364-1-4-255

Table 4.

Haplotype frequencies of six single nucleotide polymorphisms in the 17q12 chemokine gene cluster in 11 population samples

No. Haplotype Mende Temne Afr-Amer Euro-Amer Hispanic Mixteca Mixe Zapotec Chinese Indonesian PNG Global freq
1 111111 0.02 0.03 0.12 0.46 0.41 0.47 0.36 0.29 0.26 0.30 0.11 0.2570
2 211111 0.49 0.51 0.35 0.11 0.07 0.14 0.03 0.09 0.22 0.18 0.05 0.2034
3 111122 0.03 0.21 0.12 0.21 0.20 0.23 0.11 0.18 0.04 0.1217
4 222111 0.01 0.01 0.02 0.14 0.09 0.16 0.02 0.09 0.54 0.0976
5 122111 0.04 0.05 0.08 0.09 0.06 0.32 0.08 0.05 0.03 0.0709
6 221211 0.21 0.23 0.16 0.03 0.02 0.02 0.0607
7 211122 0.03 0.05 0.15 0.09 0.03 0.0323
8 111121 0.06 0.05 0.14 0.02 0.08 0.0318
9 211112 0.07 0.07 0.06 0.01 0.0191
10 221212 0.07 0.05 0.07 0.01 0.01 0.0199
11 121211 0.02 0.02 0.03 0.04 0.07 0.0163
12 111112 0.03 0.02 0.02 0.01 0.06 0.01 0.0143
13 221111 0.06 0.03 0.08 0.0154
14 221222 0.01 0.03 0.06 0.0085
15 121212 0.01 0.02 0.03 0.0056
222112 0.02 0.01 0.0034
211121 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0045
221112 0.02 0.0017
222122 0.03 0.0029
A 121112 0.02 0.0015
122122 0.02 0.01 0.0025
122112 0.02 0.0020
Hap. Diversity 0.70 ± 0.029 0.68 ± 0.029 0.81 ± 0.019 0.71 ± 0.023 0.80 ± 0.042 0.71 ± 0.031 0.78 ± 0.029 0.76 ± 0.021 0.84 ± 0.023 0.84 ± 0.022 0.67 ± 0.054

Only those estimated haplotypes above 2 per cent in any one population are listed. The inferred ancestral haplotype is denoted by the box.

Abbreviations: Afr-Amer = African-Americans; Euro-Amer = European-Americans; PNG = Papua New Guineans.