Table 2. Intron insertion sites in M. aenigmatica that are shared with other euglenid plastid DNAs.
| Genea | Shared insertion sitesa,b | Genea | Shared insertion sitesa,b |
| atpE | Maen.1, Egra.1 | rpoC1 | Maen.8, Egra.9, Elon.9 |
| atpF | Maen.1, Egra.2 | rpoC1 | Maen.9, Egra.11, Elon.11 |
| atpI | Maen.1, Egra.6 | rps2 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 |
| chlI | Maen.1, Egra.1 | rps2 | Maen.2, Egra.2, Elon.2 |
| petB | Maen.1, Egra.1 | rps2 | Maen.3, Egra.3, Elon.3 |
| psaC | Maen.1, Egra.1 | rps3 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 |
| psaC | Maen.2, Egra.2 | rps3 | Maen.2, Egra.2, Elon.2 |
| psbB | Maen.1, Egra.2 | rps8 | Maen.1, Egra.2, Elon.2 |
| psbC | Maen.1, Egra.2 | rps8 | Maen.2, Egra.3, Elon.3 |
| psbC | Maen.2, Egra.4, Evir.1, Egym.1 | rps9 | Maen.1, Egra.3 |
| psbK | Maen.1, Egra.2 | rps9 | Maen.2, Egra.5, Elon.4 |
| psbT | Maen.1, Egra.1 | rps9 | Maen.3, Egra.6, Elon.5 |
| rpl12 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 | rps11 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 |
| rpl14 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 | rps11 | Maen.2, Egra.2, Elon.2 |
| rpl16 | Maen.2, Egra.3, Elon.3 | rps14 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 |
| rpoC1 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 | rps18 | Maen.1, Egra.1 |
| rpoC1 | Maen.2, Egra.2, Elon.2 | rps18 | Maen.2, Egra.2, Egym.1 c |
| rpoC1 | Maen.3, Egra.3, Elon.3 | rps19 | Maen.1, Egra.1, Elon.1 |
| rpoC1 | Maen.4, Egra.4, Elon.4 | tufA | Maen.1, Egra.1, Elon.1 |
| rpoC1 | Maen.6, Elon.7 | ycf4 | Maen.1, Egra.1 |
| rpoC1 | Maen.7, Egra.8, Elon.8 |
a
Intron insertion sites reported to display twintrons in Euglena gracilis are highlighted in bold.
b
Maen, Monomorphina aenigmatica; Egra, Euglena gracilis; Elon, Euglena longa; Evir, Eutreptia viridis; Egym, Eutreptiella gymnastica. The number corresponds to the insertion site on the gene (labelled from 5′ to 3′).
c
The sequence of the rps18.Egym.1 intron is different from those in M. aenigmatica and E. gracilis and may be unrelated.