Table 5.
Sequences of box H/ACA snoRNA genes in E. histolytica
| ACA-Eh-SSU1315 |
TGCAAGTCTCCACAGATTGACATAAAGAATGTCTTATCTACTAAGACTTTGCAAGATTAAAACAAGTTTTAAACTCACGAGTAATATTGAATATTCGTGTTAATAGGGCTTGGAAATAATC |
| ACA-Eh-SSU631 |
ATAAAGTGGAAAATTCTATGGATGCAAATTTTTTTGCATCTTTTTTCTTTTTTGTAAATTATTTAGATGCATTTTTTCTTTGCTAATTTTCGTACCCATAAGAAGAAAGAATAACAGAAATTTAATGTATTATATTT |
| ACA-Eh-SSU1727 |
CTGTGTTTAAAGTCCAAAGATCTTCAGTTATTCGAATTGCTTCTTTGGATAATGAAAGACAGTAAAATGAGATTGATGTGAACTGTGGGACAACATTCTTGATGTCACTTTCACAATTCACACCAGTTGACAGTC |
| ACA-Eh-SSU626 |
TCCACTTCACAAAAATGACACTCATACAGAAGAGTGTGTTTTGGTATTTGACGTAGTGGAAGATTATTTGCTTAGTAATTCTATTGATATGACTATTTCTATCAATCCTACGAACTATGCAACATCA |
| ACA-Eh-SSU461 |
TGACTGAGTATGTATTTTGTTCATTTTGTCATCAGCTTGGATATTATTTGTTTATCATTCGATTTAAATAAAATAATAAGGTGTTGTGTTATAATTATAGTTAAGATGGATATAATTCATGACTATCACCTTATTTACACCT |
| ACA-Eh-SSU1675 |
TGCAGTTATCCCCTCGTTTTAATTAGTATTAAAACGAACCATTATTATACTGCAAAATTAATTTGCTTTATTTTTAAGGTTTATTTTACTATATTATTTACCTTCTATTTTAAAGCAATAAACAATT |
| ACA-Eh-SSU526 |
GCATAGTTCGTAGGATTGATAGAAATAGTCATATCAATAGAATTACTAAGCAAATAATCTTCCACTACGTCAAATACCAAAACACACTCTTCTGTATGAGTGTCATTTTTGTGAAGTGGAATAAAT |
| ACA-Eh-LSU3008 |
GGATTTATCGAAGCATTAATATACTGAAGATAGTGATTAATGTCAAATATAATCCAATAACAGTGGGTAAGAACTTATGATAAAAGTTTTATTTCTTTGAATAAAATTTTATTGTATTACTCTACATTT |
| ACA-Eh-LSU1172a |
TTATTTGTGAAGTGATTATTAATCAGTTTATATAATTGATTTTAGTCATATTTAATAAATAACATTTTTGTATGTTTCACATATTTATAATTCATTCATTTTAATTCATAAGTTAATTTATAAATACATACAAAATACATTT |
| ACA-Eh-LSU1172b |
TATATTATATAATGTCATTGGACTTACTTTTAAATTATCAGAGTGGCACAAAGATTTTATATTTATGACATTAGTCAACAAAGATATTGACTTATTTCGTAATTCTATTATTTATGGAATTGTGATTAGTATCTAACAACA |
| ACA-Eh-LSU1107b |
AAATAATTTTTTATTAATATTGTTTTTATTTAAAAATACATAAAATGTATTTTTAAATTAGAGGAAATAGAAAATATTTAAAAATAAATGAATAAATTTATCGATAATTTAACATAACAGTTTGTTTTGTTTATTGGTTTGAAATTCAAACATCA |
| ACA-Eh-LSU1650 |
TACACAATCCAAAGGATGTACAATTTTTTATTTTATGTCCATGTTAATTGTGTGAGAGAATTCTTGAAATATTGTTTAATTCTTATTGAATTGAAATATTATTTTTCAAGGTACAAAA |
| ACA-Eh-LSU3087 |
GGTGCTCCAGCTAGGCTAAACTCTTTTAGTTGTAGACCTCGTTTAAGATCACCTAGAGTAAAAGATATTATGAAAAAAAAAAGAAGACATTATTCAATTAATAATGTTTTAAATTCATAATAAATAAAT |
| ACA-EH-LSU2791 |
AAGTTAGAGTGGAATGTTTGTTAAACAAAAAGTAGTTTAAAACTACTTAAAATAGTCAATTTTTAATTTAAATTAATTGTAGGAGTTGTTGGTTATGTGTTTGAGTAAGTTTAAATTGTTAATTTACTAAAACATGACGAAATCATTTTTTCATAACAAAA |
| ACA-Eh-LSU3155 |
GTAGTTCAATTGAAATGATGATAATATTCTCTGTATTCTAATCATTTTATAAATGAAGTGCAGACAATAATGTTCCAAAGATATCTGATCTATTGAAATAATGAATTGAATATTTTAATTTGAATTTTAATACTTTTCATATTTTAATAAGA |
| ACA-Eh-LSU3221 |
TCTTTGTTTGATTCTATTTTACTTCAAATGAGGAAGTGTAATTCATTGAAGTATTGGTATAGAATAACCATTAAAAGAAGATAAATAATTTTAATCAGACTGTACATTGTTTGAAATAAGGAACATGTGTATTTAATTGGAATATAACAACA |
| ACA-Eh-LSU1159a |
AAATAAAAACAACAATAATGTTTATATAACATTCAATAAAATATTTTGTTGTTTTTCATTTAAATAAAATATGTTGTGAAGAATATTTCAAAAAAAGTAGAATTATAGTTGTTTATTTCAAATGAATATGAAATGTTTTTAATAATAAATAACT |
| ACA-Eh-LSU2700 |
TGAGACAGTTTGAAGAATGGACAAATAGAAAGGTAGGAGGTGTATTATTTGATTCGTCTGTCTCTGACTGGAATCAGAGAACATCTGTTTGTGACAAAATGTTAATTGGGAAAGAGCATATTTTGTTTGTTATAGAAGACACAA |
| ACA-Eh-LSU1080 |
GCTTTCCTTACAACGGCAAAGACATTTTATTCTTTGTGCAGTGGGAATAGAAAGCTATATTAATATTGGTGCTTTACCCTTGAAAATTTCTTTTAATTTTTAAGTCAAAAACATCATATAATT |
| ACA-Eh-LSU1343 |
AGATGGTCAAAGTTAGTGTTGCACATATGATGATTTTATAAGCAGTCATATGAAGCCGAATGAATTTATCTAATACATAGACTATTATGTATCGCAGCTTAACATCAAAGGTGGAGTTGTGTTATTGATAGATATAA |
| ACA-Eh-LSU2997b |
GGAGTGATAAAGCGGATTGGTAATAGAATAGTGTTAACAATCTCGTCAGAATCTCCTAGATTGATTATTATGTTGTATTTTCCCATGAAAAATGAATTCATTTTATCATTTAAAAAATACAATATATTT |
| ACA-Eh-LSU339 |
TGCTACATGTGTTTTTCCATCTTTTTTTGAAGAGACAAAGGATGATTTAGTATGTAGTAATACTAGTGACAAAGAAAATATAATAAGAGAAATGATTAGGTTATATCCTTTAATATTTAATGTTTGTTGTTCTTTTTCAATTACAAAA |
| ACA-Eh-LSU1123 |
TGATTGATAGTTTGATTTGGTTTATTCTGAAAATAAAATGTAGAATTATTTATCTTGTCAAACATTGATAATCAACCGTGCTTATTCATTGTTTCATATTGATATTCTTAATTTCACATTATCAACGAATGAAACGTGTTGTACAAAC |
| ACA-Eh-LSU1005 |
TTTTGAGAATTGAAAATATTTATTAAATATTTATTTTATTCAATAGTAAAGGTTTTTAATTTTCAAAACAAGAAAATAATGTTTGTGATAAAACAAAGTCATTTTTCATCCATAAAATGAAAAAGGAGTTTGCTACAAAAAAATAGTC |
| ACA-Eh-LSU1236a |
TATGGTGTTAGTGTTTGATAGAAAATTTCTTATTCAATACTTCAAGAATATTATTGGACATTTATTATAATAGAAGAACGTGTATTTGTAAAGATAATAGTATTTTTACTTGTTCTGATGCAAGTATATGTGTTAATATAG |
| ACA-Eh-LSU1236b |
TATGGTGTTAGTGTTTGATAGAAAATTTCTTATTCAATACTTCAAGAATATTATTGGACATTTATTATAATAGAAGAATGTGTATTTGTAAAGATAATAGTATTTTTACTTGTTCTGATGCAAGTATATGTGTTAATATAG |
| ACA-Eh-LSU1107a |
GCAAAATATAATAAATGGAAAATTCTATGGATGCAAATTATTTTGCATCTTTTTTCTTTTTTTGCAAATTATTTAGATGCATTTTTTCTTTGCTAATTTTCGTACCCAGTGTGATATGTCAATGAAAATGGAGAATGCAAAAGAATGAATAATT |
| ACA-Eh-LSU2288 |
AGCATATACCTTTCTCACTATATTATTGTAGCGAGACATTCAGAGATGCTAAGAATAAATGAATATTCATTTAACTTCTCTTTTATTACTTTAATGGTTTGAAAGAATAATGAATATTCGATATCT |
| ACA-Eh-LSU1159b |
TTATGTGAAATTCGATAAAATATTTTATTTTTTAAAAAATATTTTGTTGTTTTTCATTTAAATAAAATAATATGATGAAAATTTTAAAAGTGAAGAAATGAAGTTATTTATTTCAAATGAATATGAAAGGTTTTTTAATAATATTAAATAAAT |
| ACA-Eh-LSU2997a |
TGTTCCTGAAAGCGCAGAGACGCACTAGCGTTGTCTGTCGTCGCATTGGGAACAACAGAGAAGGATGATTCCATAGTGGGTGAGATGGCAATGATGCTGTTTCAATGTGGGATTGTACAGTT |
| ACA-Eh-5.8S80a |
TATAATGTAAATACTGATATGGGGTTTATGAAAACTATAAACAATATCATTTTATTCATTGTGTAAAGTAATAAAACACTTTTAATAATAGTACTAAAGTGAAGGGTATTATTTTAGAATATTATGAAAACTGTATAAAA |
| ACA-Eh-5.8S80b |
ATTTTTATTGATGCAAAATATTTAGCAACATTTTTATTGATGCAAAATATTTTGAAATAAAAATAAATCATCATTTGATATTATTAATATATTTGATAATAAATTATATTATATATTAAATACATCATATTT |
| ACA-Eh-SSU740 |
ACCTCCAAGACATTTCATACTTAAATTAAAACTTAAAGGAAGTTATGATTCTGATGAAGGTAAATTTGGAGGTAAAGAACAAGGAATATTAGAATTTGATTTCTTTATTAAAACAATTCAAAGTAATATTCCTAGACATCT |
| ACA-Eh-SSU188 |
AGAGATGTACTTAGTATGGATAACATGTATAGTGCATGGAATCCTCAATTACTTATTTCTATAAAAACTCCTCAAGCTGTTAATGTTGCCAATGCTTGTACTCTTACCATTCATTGGCAATTTGATGTTACATTG |
| ACA-Eh-SSU1216 |
GTTATGAAGAGGTTCTATTATCTGTTTATCTATTGAATTATAAGGAACTGGTTCAGGACAGAGAAATGAATCAGTTGGAGGTGTTTGTTTTTGGAATTCATTAAATGAAAAGAAGAAATTGTCACAACAGTCTGAAATAAGC |
| ACA-Eh-SSU299 |
CCATACGTTCTTTATTGGAGGCAGTCCTTATTTTGTAGAAGAAAATAAGATTTTACTTCAATCTCAAAAAACAAATGGAAACGAAGCGGTTTTAATGACAGAAGAAGAGATGAGATCATTTTATGACATTTTTGATTATTTATCTTCTTCTCAATTACAAACCACAAAA |
| ACA-Eh-SSU1212 |
TTATCATCATCAAAGAAATTTGTTATTAATGATTGCTTTGGTTGTGATGGCTGCATAGGAACAGCGACTTGGTGTTGATTAAGATAAGGGTTAAAAGTACTTTGTTGAAATTGAGGTTGTTGAATATAT |
| ACA-Eh-LSU2809 |
AGTTACTGTGCAATTTTTTGTGGGTTGAACAGTTTTCCAATTCTGATTAATTGTAAGCATAGAACTAAAACAATCATCAACAAGAGTCATTTCAGAATAAACAGTAATAGAGTCACAATCAATTTCTGAATATTTGTTATGTGTTCTTGTACAATC |
| ACA-Eh-LSU2335 |
GATTGAATATTTTCAGTTACTTCATGAACATGAGGTTTAGGAGGAATTGTTACTATTTGGTTTAAAATAACAGAATTTATACTTTCTGTTATTGGTTCAAAAAATGAATTTGATGGAAAGATAACACATAA |
| ACA-Eh-LSU2493 |
GGGCTTTAGAGTTGTGTATTTTTTCTTTTAACCAATTTCTACAAATGGTGTGAGCATGGTTATAAAGTTCAAATGAAAGTGGAGTAGAGGTGTTGTATTTAATCTTATCAAAATCTACTGCTTTATTTAATAAGT |
| ACA-Eh-LSU1176 |
GGTGGATATATTGTTAAGAATAGTTTTGGATACCAACATGGTCATTCATTAAAATATTGGCTTCAACAACATTCTATTAAAGAAGAAATGCAAATATGTCCTAATGTACGTTCGTTTGAACAATGGACTCCATTAGATGAGGATTGTATTAATAAAC |
| ACA-Eh-LSU2268 |
TACTAAGACAAATTTGTCCATTTGGAAATACATTTGGATGGAAAAATCCTTCTGGTAAATAACAACGTGGTGGTGATGCTGGGTATCCAGTAGAAAATTTCATTTCTACTGGATAATAACCATTTTCCCATATCG |
| ACA-Eh-5.8S84 |
GTTTTGAGTTATTTTTGAAGATGATTGTTTATTTTCATTTTCATCTTCACTTTCAAAGCCAAAATCATCGAACACAGAGTTTTTATCTTTTTGTGGTTCTACAAGGGTTGTAGTTTGACTTGAAGGAATAACATTATTTTGACTAGACAATC |
| EhACAOrph1 |
GCATTGCTTTTTTTGATAAATACTTATTTATTTATCTTCGCCGCAATGCAAGAAAATATTTCAATTAGCAGTGCTTTCTTTAAAGGAGGAAATCACGATATAATTGAAGACATTA |
| EhACAOrph2 |
TTTCAAATAGAATTTCCCGGAGAAATACCACAAAAGGGTGTGAAATGGGTTTTTGAAATAGAATGAACTGATTTATTAAATCAGATATGTCGCTTTCAAACGATGGACGACGTATGAGGGGAGTGAATGATAGAA |
| EhACAOrph3 |
TTGTTTTTTGATTAAACCACAATTTTTATAATATGAAAAGATAATTGTGTTTGGACAATTTAAAACGAAAAGAAATAGCGATTTAGGGTAGTTCATTCTATGTAAATATAAATGAACACTATTTAATCGCAATATTA |
| EhACAOrph4 |
GCAAAGGGTTAGTATTTTATTTAGTTATTGAAATTAGATAAAAACACCCTGTGCAAGACAAACGTGTAGATCCTAATAAAGAGAAGTCTTGTCTATTTCTTTTTATCTGTCTACAAACAAAT |
| EhACAOrph5 |
TGAGACTCTACGGTTATTAATTTATATGAATTAATAATAACCGAGTTCTCAAACAGAAAATAATCATATAAGGTATATAAAATAATAACAAATAAGATGTTATGATAATTAGATTATATGATAATAATT |
| EhACAOrph6 |
GACATGCCATAAACAATGTTTTGTATAACATTTACGACTATCATCATAAATGTTTTATAAAACACTCCGTGTCACAGTATTAAAGTGACCGTAATGTTAGGGAAGTTTCCCGAAAAGTAGGGACAACAAATCCCTAACGACAAAGGTGTCACACAAGT |
| EhACAOrph7 |
GTCATCCCTTCAGATCATGGAATTACATTCAACACTAATCTGGGAGATGATGACAAAAATAATGTCATTGAGGAGCATGATTCATTTGAGTCTGTTGAATATCTTTATGATCGTAATCTCGATGATAATC |
| EhACAOrph8 |
CCAAATAACAAAAAGAAGAGCATTAATTAGAAAGAAAAAGAATGACTAAGGTTATTTGGTAAATTAATAGTGATAAAAGGAAACATAGTTCAAAAGAGGAGTGAGCTATGTGATTGTTTAACACAACAAAG |
| EhACAOrph9 |
GCAAATGATATTCGTATATCAATTTTCAAGTTAATTGATTTGTTATTGTTTGCGAGAAAAATTAAAGATAGAAGTTATTTATATCTTTTGGTATAAATAAAAGAGAATCTTTGAACATTA |
| EhACAOrph10 |
ATTAGAAGTAAAGTGAGGATAACTTAATAACTCTGTTGTTCTTATTTGTATTGAGTTGGTCAACAGATAACAATGGACAATTATAATATAAACATTTTATTATATTTGGTGTTTCTAATTTAAATAAAATGTTACATTGTTGAACAATT |
| EhACAOrph11 |
TTGGATTTAATTGTACATTATGTCCAGCTTGTTGAGTTAAATCTGGCAGTGGAATAAGTCCAACAGATAATAAGAGACAATCACACTCAATTTCATATTCTGTTCCTGCAATTGGTGCAAGTGTCTTTGGATCACATTT |
| EhACAOrph12 |
GGTTTATCATCTTCAAATCCAATGGCTGATGCTATTTCTTTGATTTGGTTAAAAGACTCAAAATATTCTTCTTCGACAAATTTTGATTGTTCATCTAATTGATGTTTTAATTCTAAAATTTGTTGAATATAACC |
| EhACAOrph13 |
ATTATTTTGGATAATGCTAATGTTGATTTACAGGATGTTATTCGTGATAATGTGAAAATAAAAGTTCATGTTGGTCGTGGTATTGTAGTTGGAGGATTTCAGGGATCGGATGCCGCGGATGTTGAAGCTGCATATAA |
| EhACAOrph14 |
ATCATTAGAACATGTAAATGATGATAGTTCTGTGTCAGAAACACCAAACATCCCTTTTACTTTAGCTGATGATAAAACCAATTCAATAACTAGTGAAATAGCTTTTTGTTGTTTATTATAATAATATTTATCACTAATACCATTGAAACAAAA |
| EhACAOrph15 | GTAGTGGAACAATAAAATGACTATTAGGTAGTGATAGATAGTCATTATCATCAATAATTATTTTCTCTATTACTACAGCACTATTTAATATTTGTAATTCTACAGAAGTTTCATTTTTCTTAAGAGTATAAAGAAAAGGTGGATAATG |
Note: Box H and box ACA are depicted in bold. Antisense elements are in italics.