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. 2013 Jan 18;3:438. doi: 10.3389/fmicb.2012.00438

Table A2.

Values for diversity statistics derived from Mothur.

Site z Sobs C1 LL UL ACE LL UL H’ LL UL 1/D LL UL Cov
A2 18 57 111 76 209 117 92 158 3.26 3.13 3.39 16.2 13.7 19.9 0.92

A4 17 56 79 64 124 78 65 108 3.05 2.89 3.21 8.9 7.1 11.7 0.94
43 109 216 165 316 442 362 547 3.83 3.66 4.00 18.2 14.0 25.7 0.80

A6 2 73 166 111 297 206 162 273 3.44 3.30 3.58 16.0 12.9 21.1 0.89
20 74 116 92 171 172 136 229 3.33 3.17 3.49 11.7 9.3 15.8 0.90
80 94 212 151 342 323 259 412 3.58 3.40 3.75 12.4 9.6 17.5 0.83
160 76 139 104 218 198 155 262 3.42 3.25 3.58 14.4 11.5 19.2 0.87
350 113 350 233 579 798 659 973 3.82 3.66 3.98 20.3 16.1 27.4 0.77
700 78 181 124 304 297 228 397 3.28 3.09 3.46 10.5 8.3 14.2 0.84
1700 130 324 234 491 520 425 645 4.05 3.90 4.21 23.7 18.6 32.8 0.77

B4 200 55 75 62 108 85 68 124 2.96 2.81 3.11 11.3 9.8 13.4 0.93
530 75 151 110 242 332 263 427 3.25 3.08 3.42 11.4 9.2 15.0 0.86

B5 2 98 233 161 388 263 212 337 3.59 3.42 3.76 11.8 9.3 16.3 0.85
200 57 84 67 128 143 111 194 3.21 3.08 3.34 16.0 13.6 19.3 0.92
450 69 107 85 159 158 125 209 3.37 3.22 3.52 15.5 12.6 20.0 0.90
760 59 144 93 274 225 170 308 2.60 2.41 2.80 4.9 4.1 6.2 0.90

C4 2 86 176 127 284 254 203 326 3.68 3.54 3.82 22.1 18.0 28.7 0.86
200 62 100 78 154 178 139 237 2.84 2.66 3.02 6.9 5.7 8.8 0.90
700 74 197 125 373 256 201 336 3.51 3.37 3.66 18.7 15.0 24.7 0.87

D3 25 96 202 148 314 301 241 385 3.50 3.32 3.69 10.5 8.2 14.6 0.83
68 77 182 122 320 197 156 260 3.15 2.97 3.34 9.0 7.4 11.4 0.87

D5 2 85 122 102 168 130 108 173 3.40 3.21 3.58 8.9 7.0 12.2 0.89
50 82 130 104 188 136 110 186 3.15 2.95 3.34 7.5 6.1 9.7 0.88
100 78 110 92 150 129 104 178 3.05 2.84 3.26 5.9 4.7 7.7 0.89
350 95 217 155 345 317 248 418 3.60 3.44 3.76 16.0 12.7 21.5 0.83
450 170 719 478 1147 2101 1799 2459 4.17 4.01 4.33 21.9 17.2 30.0 0.69
900 76 217 137 403 321 248 424 3.24 3.07 3.40 12.0 10.0 15.2 0.86

E2 6 86 167 124 259 234 187 304 3.38 3.19 3.56 9.8 7.7 13.4 0.86

E6 200 105 213 159 319 346 281 435 3.96 3.82 4.10 30.8 25.1 39.7 0.82
800 34 46 37 73 51 40 82 1.52 1.32 1.72 2.0 1.8 2.3 0.96

F6 2 71 106 86 153 147 119 193 2.88 2.68 3.08 5.2 4.3 6.8 0.90
200 84 152 115 232 217 174 281 3.59 3.43 3.74 17.2 13.8 23.0 0.86
950 63 163 103 312 207 154 291 3.00 2.84 3.16 10.3 8.7 12.7 0.88

H1 7 67 94 77 136 95 80 129 3.14 2.96 3.32 8.5 6.8 11.3 0.92

H3 20 89 187 135 298 261 207 340 3.27 3.09 3.45 8.7 7.0 11.4 0.86

H6 2 58 87 69 134 120 95 162 2.77 2.59 2.95 5.7 4.6 7.3 0.92
25 56 86 67 137 115 91 158 2.92 2.75 3.09 7.4 6.0 9.7 0.93
45 64 87 73 124 127 102 168 3.21 3.05 3.37 10.7 8.5 14.3 0.92
110 93 199 144 314 261 209 336 3.55 3.37 3.73 12.6 9.8 17.4 0.83
280 84 174 124 286 226 180 292 3.70 3.57 3.84 24.9 20.7 31.1 0.86

MR1 2 83 126 103 176 192 154 250 3.64 3.49 3.80 20.3 16.3 26.9 0.86

MR2 8 91 177 133 269 263 209 342 3.44 3.26 3.62 10.6 8.3 14.5 0.84

MR3 110 101 184 142 268 174 140 237 4.02 3.87 4.17 32.1 25.2 44.1 0.80

Sobs, observed richness; C1, Chao1; H’, Shannon index; 1/D, inverse Simpson’s index; Cov, coverage. LL and UL, 95% lower and upper confidence limits, respectively for C1, ACE, H’, and 1/D.