Table 2.

Results after train and test on the two different input coding schemes.

		MSA				MSA+SS
	Spec	Sens	MCC	FPR	Spec	Sens	MCC	FPR
Oxidoreductase	0.90	0.89	0.87	0.02	0.88	0.88	0.86	0.02
Transferase	0.90	0.89	0.84	0.05	0.90	0.87	0.82	0.06
Hydrolase	0.89	0.92	0.84	0.07	0.87	0.91	0.82	0.08
Lyase	0.91	0.84	0.87	0.00	0.89	0.82	0.85	0.01
Isomerase	0.81	0.72	0.76	0.01	0.84	0.69	0.76	0.00
Ligase	0.89	0.85	0.86	0.01	0.87	0.84	0.85	0.01
GC	0.86				0.84
Q	0.96				0.96