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. 2013 Jan 30;8(1):e55186. doi: 10.1371/journal.pone.0055186

Table 1. Identification of Smad2/3 inducible miRNAs by small RNA deep-sequencing and real-time qPCR.

miRNA TAG1 J1
Total reads Normalized reads Fold-change
0 h 16 h 16+12 h 0 h 16 h 16+12 h 16h v 0h 16+12h v 16h
DS qPCR DS qPCR
485-3p 15123 3204 14883 1380 282 1504 −4.89 5.33
181d-5p 107042 42731 183584 9770 3763 18552 −2.60 −2.07 4.93 4.36 1.09
423-5p 62261 30061 112927 5683 2647 11412 −2.15 1.12 4.31 1.11 1.32
25-5p 15513 8015 29645 1416 706 2996 −2.01 4.24
320-3p 90928 52727 174984 8300 4644 17683 −1.79 1.04 3.81 1.16 1.2
7a-5p 12989 9111 28023 1186 802 2832 −1.48 −2.58 3.53 2.8 1.07
128-3p 10758 6212 14348 982 547 1450 −1.79 2.65
181c-5p 11420 6098 13507 1042 537 1365 −1.94 −1.76 2.54 3.66 −1.01
295-5p 15726 10758 22723 1435 947 2296 −1.52 2.42
543-3p 77103 24436 50833 7038 2152 5137 −3.27 2.39
298-5p 20568 13599 27069 1877 1198 2735 −1.57 2.28
323-3p 12677 6410 12510 1157 565 1264 −2.05 2.24
290-5p 390434 205450 370150 35638 18094 37406 −1.97 −1.3 2.07 1.46 −1.04
485-5p 11901 5602 9914 1086 493 1002 −2.20 −1.42 2.03 1.1 1.09
433-3p 16712 6807 11648 1525 599 1177 −2.54 1.96
744-5p 16396 12174 20521 1497 1072 2074 −1.40 −1.54 1.93 1.59 −1.09
382-5p 21060 11862 19882 1922 1045 2009 −1.84 −1.69 1.92 1.45 1
672-5p 43113 19036 31043 3935 1676 3137 −2.35 1.87
669c-5p 15701 12393 19642 1433 1091 1985 −1.31 1.82
185-5p 26062 17301 27039 2379 1524 2732 −1.56 −1.34 1.79 1.28 1.09
541-5p 28812 19793 30572 2630 1743 3089 −1.51 1.77
92a-3p 58724 36877 55151 5360 3248 5573 −1.65 1.72
130a-3p 15364 11642 16887 1402 1025 1707 −1.37 −1.32 1.66 1.65 1.02
363-5p 24461 13906 19919 2233 1225 2013 −1.82 1.64
291a-5p 28030 21958 29674 2558 1934 2999 −1.32 1.55
25-3p 140851 111946 148185 12856 9859 14975 −1.30 −1.61 1.52 1.71 1.05
341-3p 14130 9000 11191 1290 793 1131 −1.63 1.43
382-3p 12866 7865 9310 1174 693 941 −1.70 1.36

DS  =  Deep-sequencing.