TABLE 3.
Relative mass isotopomer fractions of intracellular alanine, valine, glutamate, and lysine of lysine-producing C. glutamicum ATCC 13287 cultivated in a 1:1 mixture of [1− 13C]- and [13C6]glucose
Time (h) or data typea | Relative mass isotopomer fractions for amino acid
|
|||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Alanine
|
Valine
|
Glutamate
|
Lysine
|
|||||||||||||||||||
M0 | M1 | M2 | M0 | M1 | M2 | M3 | M4 | M5 | M0 | M1 | M2 | M3 | M4 | M5 | M0 | M1 | M2 | M3 | M4 | M5 | M6 | |
5.8 | ||||||||||||||||||||||
Exp | 0.289 | 0.263 | 0.448 | 0.080 | 0.118 | 0.193 | 0.243 | 0.162 | 0.204 | 0.043 | 0.104 | 0.204 | 0.263 | 0.203 | 0.157 | *b | ||||||
Calc | 0.291 | 0.242 | 0.467 | 0.080 | 0.119 | 0.198 | 0.245 | 0.163 | 0.196 | 0.043 | 0.101 | 0.208 | 0.259 | 0.231 | 0.159 | |||||||
6.9 | ||||||||||||||||||||||
Exp | 0.300 | 0.246 | 0.455 | 0.086 | 0.118 | 0.194 | 0.242 | 0.161 | 0.199 | 0.039 | 0.100 | 0.203 | 0.263 | 0.235 | 0.160 | 0.037 | 0.082 | 0.147 | 0.205 | 0.216 | 0.186 | 0.127 |
Calc | 0.296 | 0.238 | 0.466 | 0.084 | 0.118 | 0.197 | 0.243 | 0.160 | 0.199 | 0.039 | 0.101 | 0.205 | 0.263 | 0.233 | 0.160 | 0.033 | 0.086 | 0.147 | 0.208 | 0.211 | 0.184 | 0.132 |
8.1 | ||||||||||||||||||||||
Exp | 0.290 | 0.245 | 0.465 | 0.082 | 0.118 | 0.194 | 0.243 | 0.163 | 0.200 | 0.037 | 0.097 | 0.201 | 0.264 | 0.239 | 0.162 | 0.035 | 0.081 | 0.148 | 0.207 | 0.217 | 0.186 | 0.126 |
Calc | 0.291 | 0.240 | 0.468 | 0.080 | 0.117 | 0.196 | 0.244 | 0.162 | 0.201 | 0.037 | 0.098 | 0.203 | 0.263 | 0.237 | 0.163 | 0.030 | 0.080 | 0.146 | 0.209 | 0.217 | 0.188 | 0.130 |
9.2 | ||||||||||||||||||||||
Exp | 0.288 | 0.248 | 0.465 | 0.081 | 0.117 | 0.194 | 0.243 | 0.164 | 0.201 | 0.036 | 0.096 | 0.200 | 0.264 | 0.241 | 0.163 | 0.032 | 0.079 | 0.146 | 0.205 | 0.219 | 0.190 | 0.129 |
Calc | 0.288 | 0.242 | 0.470 | 0.079 | 0.117 | 0.196 | 0.243 | 0.163 | 0.202 | 0.036 | 0.097 | 0.202 | 0.264 | 0.239 | 0.164 | 0.030 | 0.079 | 0.146 | 0.208 | 0.219 | 0.190 | 0.131 |
Experimental GC/MS data (exp) and values predicted by the solution of the mathematical model corresponding to the optimized set of fluxes (calc) are shown.
*, at this time point the intracellular lysine concentration was too small to obtain reliable mass isotopomer fractions.