Table 2.
Previously annotated protein coding genes predicted herein to be miRNA genes in tammar
| miRNA count | Ensembl Meug 1.0 annotation | Symbol | Hairpin alignment | mRNA | mirBase |
|---|---|---|---|---|---|
| 1389 |
ENSMEUG00000014939 |
PANK3 |
((((.(((((((((((.((.(((((((((((.(((......)))))))))))))).)))))).))))))).))))........(((((((......))))))). |
X |
age-mir-103 |
| 1145 |
ENSMEUG00000004480 |
NFYC |
((((((.((..((((...)))).))))))))(((((((.((((((((((((((((.(((((((((((........)))))))))))))))))))))))))))))))))). |
X |
eca-mir-30e |
| 554 |
ENSMEUG00000000911 |
CDC20B |
......((((.(((…))).))))..((.(((((((((((((((((((((.((.(((((((........))))))))).)))).))))))))))))))))).)). |
X |
|
| 349 |
ENSMEUG00000016575 |
HOXD4 |
.(((.(((((((....))).)))).))).(((((.((((((((.((((.(((((.((((((((((........)))))))))).))))))))).)))))))).))))). |
X |
aca-mir-10b |
| 79 |
ENSMEUG00000012110 |
PFDN5 |
…((((((((((((...((((.((.......)).))))))))))((((((((.((...)).))))))))...)))))).....((((...)))). |
|
|
| 26 |
ENSMEUG00000012937 |
BCAS3 |
......((((.((((((((.......)))))))).))))(((((((.(((…((.((.(((…(((((((…)))))))..))).)).)).)))))))))). |
|
|
| 26 |
ENSMEUG00000008344 |
MYOZ2 |
(((((((.((((.((.(((((((((((((.......((.((((…(((((((......))))))))))).))))))))))))))).)))))).)))…)))). |
X |
|
| 26 | ENSMEUG00000004683 | GRIA1 | ...(((...(((((.((((((((((.(((((((.((.......)).)))))))..))))))).(((.((((…)))))))...))))))))....))).. | X |
For each, the number of miRNA reads, identification of mRNA transcripts in embryos and any identified miRBase orthologs are indicated.