Table 3. Population pairwise F_ST between the twenty-eight populations significantly differentiated calculated with ARLEQUIN software.

	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17	18	19	20	21	22	23	24	25	26	27	28
1	/	***	***	***	***	***	ns	***	***	***	*	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
2	0.39	/	***	ns	***	***	ns	***	***	ns	*	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
3	0.38	0.19	/	*	***	***	*	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
4	0.47	0.66	0.24	/	ns	ns	ns	ns	ns	ns	ns	***	***	***	***	***	***	*	***	***	*	***	***	***	***	***	***	***
5	0.22	0.11	0.14	0.01	/	***	ns	***	***	ns	ns	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
6	0.30	0.22	0.27	0.10	0.13	/	*	***	*	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
7	0.07	0.22	0.20	0.10	0.01	0.16	/	*	ns	ns	ns	***	***	***	***	*	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
8	0.27	0.22	0.26	0.01	0.10	0.06	0.10	/	ns	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
9	0.26	0.23	0.28	0.06	0.08	0.08	0.08	0.04	/	*	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
10	0.29	0.07	0.22	0.02	0.02	0.13	0.05	0.14	0.12	/	ns	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
11	0.15	0.17	0.17	0.08	0.02	0.16	0.08	0.13	0.13	0.04	/	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***	***
12	0.63	0.54	0.58	0.43	0.46	0.51	0.54	0.45	0.49	0.49	0.50	/	***	*	***	***	***	***	*	***	***	***	ns	***	***	***	***	***
13	0.70	0.57	0.60	0.53	0.48	0.52	0.64	0.45	0.52	0.55	0.55	0.11	/	*	***	*	*	*	ns	*	***	***	ns	***	***	***	***	***
14	0.63	0.50	0.54	0.35	0.42	0.46	0.50	0.39	0.45	0.44	0.45	0.04	0.04	/	***	ns	***	*	ns	***	***	***	*	***	*	***	***	*
15	0.61	0.49	0.54	0.37	0.40	0.46	0.49	0.40	0.45	0.43	0.45	0.05	0.18	0.09	/	***	***	***	***	***	***	***	*	***	***	***	***	***
16	0.70	0.54	0.58	0.46	0.45	0.48	0.61	0.40	0.49	0.50	0.50	0.17	0.08	0.06	0.22	/	*	ns	ns	nsns	ns	***	***	***	*	***	***	ns
17	0.68	0.56	0.60	0.46	0.47	0.51	0.59	0.43	0.50	0.52	0.52	0.10	0.08	0.06	0.17	0.06	/	***	ns	***	***	***	*	***	***	***	***	ns
18	0.67	0.52	0.55	0.44	0.42	0.47	0.56	0.40	0.47	0.46	0.47	0.13	0.15	0.08	0.20	0.13	0.12	/	ns	*	*	*	ns	***	ns	***	***	*
19	0.65	0.54	0.58	0.43	0.45	0.49	0.54	0.41	0.48	0.49	0.49	0.06	0.02	0.02	0.13	0.04	0.02	0.04	/	*	***	*	ns	***	ns	ns	***	***
20	0.64	0.56	0.59	0.44	0.48	0.52	0.55	0.44	0.50	0.52	0.53	0.15	0.05	0.07	0.17	0.02	0.10	0.11	0.05	/	***	***	*	***	***	***	***	*
21	0.60	0.21	0.54	0.38	0.43	0.46	0.50	0.40	0.45	0.46	0.46	0.21	0.12	0.14	0.18	0.05	0.14	0.18	0.11	0.06	/	***	***	***	***	***	***	*
22	0.72	0.64	0.66	0.62	0.55	0.59	0.67	0.52	0.59	0.63	0.62	0.17	0.12	0.16	0.30	0.23	0.14	0.09	0.06	0.18	0.26	/	ns	***	***	***	***	***
23	0.65	0.51	0.54	0.40	0.41	0.46	0.51	0.39	0.45	0.43	0.43	0.08	0.06	0.05	0.15	0.15	0.08	0.03	0.01	0.09	0.15	0.01	/	*	*	***	***	***
24	0.64	0.52	0.57	0.40	0.45	0.50	0.54	0.44	0.49	0.46	0.49	0.06	0.20	0.08	0.09	0.24	0.16	0.18	0.11	0.20	0.24	0.25	0.12	/	***	ns	***	***
25	0.61	0.51	0.56	0.38	0.44	0.48	0.50	0.42	0.46	0.46	0.47	0.09	0.13	0.04	0.14	0.09	0.08	0.02	0.03	0.11	0.17	0.13	0.07	0.10	/	***	***	***
26	0.60	0.51	0.55	0.39	0.44	0.48	0.50	0.42	0.46	0.46	0.46	0.05	0.09	0.07	0.09	0.16	0.12	0.10	0.06	0.15	0.19	0.17	0.08	0.03	0.04	/	***	***
27	0.73	0.61	0.63	0.58	0.52	0.56	0.67	0.52	0.59	0.57	0.59	0.33	0.52	0.37	0.32	0.49	0.43	0.45	0.41	0.42	0.42	0.56	0.44	0.29	0.28	0.25	/	***
28	0.68	0.52	0.57	0.38	0.43	0.47	0.56	0.39	0.47	0.46	0.48	0.17	0.15	0.06	0.19	0.01	0.08	0.16	0.08	0.06	0.09	0.30	0.19	0.22	0.11	0.09	0.63	/

The significance level is shown above the diagonal, *indicates P<0.05, **indicates P<0.005, ***indicates P<0.0005; ns, non-significant. From line 1 to 11: H2 lineage (S. c. nanus, S. c. brachyceros and S. c. aequinoctialis); from line 12 to 28: H1 lineage (S. c. caffer); bold/italic written value: ecophenotype nanus. 1: Campo ma’an; 2: Lope; 3: Gamba; 4: Ngoto Forest; 5: Benoue; 6: Mole; 7: Arly, Pama, Singou; 8: Pendjari; 9: W; 10: Zakouma; 11: Bamingui-Bangoran; 12: Queen Elizabeth; 13: Lake Mburo; 14: Murchison falls; 15: Kidepo valley; 16: Laikipia; 17: Amboseli; 18: Nairobi; 19: Tsavo; 20: Masai Mara- Serengeti- Maswa; 21: Nakuru; 22: Arusha; 23: Kizigo; 24: Hwange-Chobe; 25: Kruger; 26: Gonarezhou; 27: Hluhluwe-Imfolozi; 28: Mount Elgon.