Table 1.

Primers used in this study.

Primer Name	Sequence
stcE 5′ 693	5′-CCGCTCCGGTGAACTGGAGAATA-3′
stcE 3′ 1841	5′-CCTTATCTGCGGAGGCTGTAGGG-3′
etpD SacI 5′ 1	5′-CCGAGCTCCGTGTTCACTACAGTAATTTTG-3′
etpD XbaI 3′ 1929	5′-CCTCTAGATTACATCTCCTGCGCATAAA-3′
katP 5′ 16	5′-CTTCCTGTTCTGATTCTTCTGG-3′
katP 3′ 2141	5′-AACTTATTTCTCGCATCATCC-3′
ler 5′ 38	5′-CACATACAACAAGTCCATACATTCAGC-3′
ler 3′ 378	5′-CAGCGGTATTATTTCTTCTTCAGTGTCC-3′
espA 5′ 81	5′-GTCGAAGGATGAGGTGGTTAAGCTA-3′
espA 3′ 535	5′-ATTGCACATCAGAACGTGCACTCG-3′
cadA 5′ 455	5′-ACATGGGTGGTACTGCATTCCAGA-3′
cadA 3′ 1603	5′-ACAGCAGGTTATACGGACCGGTTT-3′
ipaB 5′ 1	5′-ATGCATAATGTAAGCACCACAACC-3′
ipaB 3′ 1743	5′-TCAAGCAGTAGTTTGTTGCAAAAT-3′
ipaD 5′ 1	5′-ATGAATATAACAACTCTGACTAAT-3′
ipaD 3′ 999	5′-TCAGAAATGGAGAAAAAGTTTATC-3′
virK 5′ 188	5′-TTCTGGCAATACAACCCACGTTGC-3′
virK 3′ 915	5′-TGCATCCAAAGAGCGGATAGCAGT-3′
icsA 5′ 348	5′-AGGTCATGGTGGTGCTGGTGATAA-3′
icsA 3′ 2002	5′-CTGCAATTTCCAGCCGGTCAGTTT-3′
ipaH7.8 5′ 500	5′-ACAGGCTGACAACATTACCCGACT-3′
ipaH7.8 3′ 1624	5′-TCTGCTGTTCAGTCTCACGCATCA-3′
mxiM 5′ 27	5′-TGCTCTGCAGCAAAGATTAAATAGTGAAGA-3′
mxiM 3′ 407	5′-TACCATGTCGAATCATCTGCCTCTCTC-3′
traC 5′ 318	5′-TGGTGACAGGATTGAATACGGGCT-3′
traC 3′ 1732	5′-GCAACAGCAGACCTTCATGCACTT-3′
IR ApaI 5′ 1	5′-AAGGGCCCCTCTGAGGTGTCTGTTAAACCCGTGG-3′
etpD 3′ 1803	5′-CGACTGCACCTGTTCCTGATTA-3′