Table 2.
Genes associated with the cytoskeleton with expression changes of at least two fold in at least one treatment group.
| Astrocytes v HEPES astrocytes | TNF v HEPES TNF | Astrocytes v TNF | HEPES v HEPES TNF | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
| ||||||||
| fold change | Std Dev | fold change | Std Dev | fold change | Std Dev | fold change | Std Dev | |
| Actin α2 | −4.19 | 1.82 | −6.67 | 0.21 | −2.48 | 0.09 | −4.13 | 0.35 |
| Actin γ2 | −3.24 | 0.68 | −6.8 | 0.7 | −3.3 | 0.15 | −7.58 | 0.18 |
| Actin cytoplasmic 2
|
-- | -- | −2.46 | 0.48 | -- | -- | -- | -- |
| Tubulin α | -- | -- | -- | -- | -- | -- | −2.9 | 0.03 |
| Tubulin γ | 2.11 | 0.12 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Tubulin α1 | 3.15 | 0.49 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Tubulin α2 | 3.11 | 0.19 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Tubulin β | -- | -- | -- | -- | -- | -- | −2.4 | 0.56 |
| Tubulin β4 | 2.66 | 0.04 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Tubulin α6 | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Tubulin α | -- | -- | −2.47 | 0.04 | -- | -- | −8.44 | 0.44 |
| Tubulin δ4 | -- | -- | -- | -- | 2.94 | 0.94 | -- | -- |
| Dynein | −8.57 | 1.13 | -- | -- | −4.06 | 0.39 | -- | -- |
| Plectin | −3.02 | 0.4 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Tropomyosin 2 | −2.41 | 0.12 | −2.94 | 0.21 | -- | -- | -- | -- |
| Tropomyosin 1 | −2.12 | 0.06 | -- | -- | −2.77 | 0.01 | -- | -- |
| RHO Gap | −2.38 | 0.47 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| RHO Gap22 | 3.31 | 0.37 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| PTK2 | -- | -- | -- | -- | −2.76 | 0.18 | −2.97 | 0.04 |
| MLCK | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| PKC μ | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| PKC ζ | 2.65 | 0.12 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| PI 4,5 Ki--se | −2.71 | 0.57 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| PKC B | -- | -- | −4.77 | 0.21 | -- | -- | -- | -- |
| Sorting nexin 7 | −2.51 | 0.16 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Palladin | −4.43 | 1.06 | -- | -- | -- | -- | ||
| Filamin A | −1.55 | 1.26 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Vinculin | −2.82 | 0.66 | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
| Vilin | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- | -- |
Relative fold change for mRNA extracted from astrocytes.