Skip to main content
. 2013 Feb 8;3(2):e102. doi: 10.1038/bcj.2012.47

Table 2. Mutation profile of six cell lines and five primary MM samples with respect to adhesion and RTK signaling.

Gene AMO1 U266 OPM2 MM1S JJN3 L363 Patient 1 Patient 2 Patient 3 Patient 4 Patient 5
MMP15   x(homoz.)   x         x    
MUC4         xx (<2)       x    
COL10A1       x     x        
SDK1         x   x        
LRFN5   x   x     x        
THBS1 x           x        
SLAMF1             x        
COL6A3     xx         x      
VCAN             x        
THSD7A             x        
ALOX12B     x (<2)       x        
HSD17B1               x      
NCAM2             x        
ADAM29   x   x              
ADAMTS1 x                    
ADAMTSL1       x(homoz.)              
BCAN x   x                
COL17A1       x              
COL7A1       x              
DCHS1   x   x              
DCHS2       x              
ITGA10   x   x              
ODZ1       x              
SIGLEC1       x              
WHSC1       x              
LAMB2       x              
PCDHGA7   x   xx x            
ADAMTS19   x (<2) x                  
ADAMTS9 x                    
CAMTA1     x                
ADAMTS2 x (<2)   x                
COL12A1           x          
COL16A1           x          
HS6ST3   x   x              
LAMA5     x x              
NRXN1           x          
ODZ4           x          
PCDH10 x                    
ADAMTS18     x                
CDH11           x          
CELSR2         x            
GPC6 x     x              
ITGB1   x                  
LAMB1           x          
PCDH15         x(homoz.)            
PCDH17         x            
PCDH20 x                    
RELN   xx                  
SPOCK1     x                
TLN2           x          
TNC x     x (<2)              
TGFBR2             x        
CHIA       x(homoz.)              
NTRK1       x             x
EPHB2             x        
EPHA8   x   x     x        
NTRK2           x         xx
EGFR x     x              
ERBB3 x         x          
IGF1R           x          
TTN         x (<2)            
HK3             x        
STAM2             x        
IKBKE             x        
ADRBK1             x        
AKAP1             x        
TYK2       x              
KRAS x     x           x  
NRAS           x          
BRAF   x                  
MAP2K2 x           x        

Abbreviations: MM, multiple myeloma; RTK, receptor tyrosine kinase; x, mutated; xx, mutated twice in the same sample; homoz., homozygous

Adhesion molecules, RTKs and some downstream molecules are listed that were mutated in at least 1 of the5 primary MM or in at least 1 cell line, plus at least 1 of the 38 published primary MM.5 All mutations mentioned (x, xx, homoz.) were damaging in at least two functional predictors, if not otherwise specified (<2=less than 2 predictors). Genes that belonged to the same signaling network according to the STRING database or manual literature search were highlighted in bold and italics (bold: medium confidence; italics: low confidence). The mutation details for the 38 primary MM5 are shown in Supplementary Table S12.