Table 2.
Association of the most significant SNPs in the NCK2 gene with the six substances dependence in African-origin sen.
| Gene | SNP | Method | Alcohol | Cocaine | Marijuana | Nicotine | Opiates | Others |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NCK2 | rs2377339 | Logistic regression | 2.46E − 2 | 5.09E − 2 | 4.48E − 2 | 7.01E − 2 | 1.10E − 7 | 3.84E − 3 |
| Standard allelic test | 6.03E − 3 | 4.34E − 2 | 3.89E − 2 | 6.25E − 2 | 1.33E − 11 | 1.78E − 3 | ||
| rs7589342 | Logistic regression | 2.84E − 1 | 8.79E − 1 | 9.35E − 1 | 8.60E − 1 | 1.45E − 4 | 4.26E − 1 | |
| Standard allelic test | 2.81E − 1 | 8.78E − 1 | 9.34E − 1 | 8.59E − 1 | 5.39E − 5 | 4.22E − 1 | ||
| rs12995333 | Logistic regression | 1.71E − 1 | 7.51E − 1 | 7.16E − 1 | 9.86E − 1 | 1.89E − 4 | 4.69E − 1 | |
| Standard allelic test | 1.68E − 1 | 7.51E − 1 | 7.15E − 1 | 9.86E − 1 | 7.82E − 5 | 4.67E − 1 | ||
| rs12053259 | Logistic regression | 1.39E − 1 | 9.43E − 1 | 7.42E − 1 | 9.01E − 1 | 2.31E − 4 | 4.86E − 1 | |
| Standard allelic test | 1.33E − 1 | 9.42E − 1 | 7.39E − 1 | 9E − 1 | 8.67E − 5 | 4.80E − 1 | ||
| NCK2 | — | KGG-logistic | 1.83E − 1 | 8.15E − 1 | 5.92E − 1 | 9.56E − 3 | 2.70E − 6 | 9.45E − 2 |
| NCK2 | — | KGG- Standard allelic test | 1.41E − 1 | 8.16E − 1 | 4.83E − 1 | 8.71E − 3 | 3.12E − 10 | 4.17E − 2 |