Table 2.
ASSAY TYPE | PRIMER SET DETECTION | SUBJECT GROUP n with positive results (%) | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
BORNAVIRUS STRAIN | GENE SEQUENCE | SZ | SZ-C | BD | BD-C | MDD | MDD-C | |
n=52 | n=52 | n=66 | n=66 | n=80 | n=80 | |||
REAL TIME RT-PCR | He/80 | N gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
P gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
Strain V | N gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
P gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
No/98 | N gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
P gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
Universal | N gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | |
P gene | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | ||
PCR | Avian bornaviruses, genotypes 1–4 | M gene | 0 (0)§ | ND | 0 (0) | ND | 0 (0) | ND |
P gene | 0 (0)§ | ND | 0 (0) | ND | 0 (0) | ND |
SZ, n=24; BD, n=33; MDD, n=40