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. 2013 May;33(10):2091–2101. doi: 10.1128/MCB.01569-12

Table 1.

Primers for real-time PCR assays

Gene or primer Primer sequence
Genes
    HPRT 5′-GGGGGCTATAAGTTCTTTGC-3′
5′-TCCAACACTTCGAGAGGTCC-3′
    Igκ 5′-GGCTGCAGSTTCAGTGGCAGTGGRTCWGGRAC-3′
5′-AGGACGCCATTTTGTCGTTCACT-3′
    IgH 5′-CTGCCCAGCACCATTTCCTT-3′
5′-TCTGTGGTGAAGCCAGATTC-3′
    RAG-1 5′-ATGGCTGCCTCCTTGCCGTCT-3′
5′-GTATCTCCGGCTGTGCCCGTC-3′
    RAG-2 5′-ATGTCCCTGCAGATGGTAACA-3′
5′-TAAATCTTATCGGAAAGCTCA-3′
    λ5 5′-GGGTCTAGTGGATGGTGTCCACCACATAC-3′
5′-GAAGATTCTTTAAGGAAGGCAGGAACAGAGTG-3′
    VpreB 5′-TCCTGCTCATGCTGCTGGCCTATCTCACAG-3′
5′-CAGAGATGCTCAGATACCCCAGGTTCCTGGTC-3′
    TdT 5′-GTGGCTTCCACGCCTTATGACATCCGATTTCG-3′
5′-TCCCATGCATTCGATGAGCCAGGAGATGTC-3′
    BLIMP 5′-GACTGGTTACAAGACTCTTCCTTACCCTCTG-3′
5′-GTGGGTCTTGAGATTGCTTGTGCTGCTAAATC-3′
    IL-7R 5′-GCTCTGGGTAGAGCTTTCGCTATAGTTTTCTG-3′
5′-TGCAGCTTGTTAAGAGTTAGGCATTTCACTCG-3′
Primers
    Vλ-f 5′-GCCATTTCCCAGGCTGTTGTGACTCAGG-3′
    Vλ-r 5′-ACTCACCTAGGACAGTCAGTTTGGTTCC-3′
    Jκ1-2 5′-GACAACGGAAGAAAGAGACTTTGGA-3′
    VκD 5′-GGCTGCAGSTTCAGTGGCAGTGGRTCWGGRAC-3′
    RS101 5′-ACATGGAAGTTTTCCTGGGAGAATAT-3′
    IRS-f 5′-ATGTGAACCCCCGCGGTAGCAT-3′
    IRS-r 5′-GGAACATGGAAGTTTTCCTGGGAG-3′