Skip to main content
. 2012 Dec 3;6(3):486–496. doi: 10.1111/eva.12032

Table 2.

Names and combinations of the primers

Primers used to characterize the sdY sequence in several salmonid species
Species Primer Pair
Oncorhynchus masou sdY E1Sb sdY E4AS1a
Salmotrutta sdY E1Sb sdY E4AS1a
Salmosalar sdY E1Sb sdY E4AS1a
Parahuchoperryi sdY E1Sb sdY E4AS1a
Salvelinus alpinus sdY E1Sb sdY E4AS1a
Salvelinus fontinalis sdY E1Sb sdY E4AS1a
Coregonus lavaretus sdY E1Sb sdY E4AS1a
Huchohucho sdY E1Sa sdY E4AS1a
Parahuchoperryi sdY E1Sa sdY E4AS1a
Thymallusthymallus sdY E1Sb sdY E4AS1a
Stenodus leucichthys (E1) OmyY1Fw11022 OmyY1Rv11199
Stenodus leucichthys (E2) OmyY1Fw11178 OmyY1Rv11918
Stenodus leucichthys (E3) OmyY1Fw13771 OmyY1Rv13914
Stenodus leucichthys (E4) OmyY1Fw15916 sdY E4AS1a
Primers for genotyping sdY in several species
Species Primer Pair
Coregonus lavaretus sdY E1S1 sdY E2AS4
Coregonus clupeaformis sdY E1S1 sdY E2AS4
Stenodus leucichthys sdY E2S1 sdY E2AS4
Thymallus thymallus sdY E1S1 sdY E2AS4
Oncorhynchus mykiss sdY E2S1 sdY E2AS2
Oncorhynchus masou sdY E1S1 sdY E2AS5
Oncorhynchus tshawytscha sdY E2S1 sdY E2AS4
Salvelinus malma malma sdY E2S1 sdY E2AS4
Salvelinusalpinus sdY E2S1 sdY E2AS4
Salvelinus fontinalis sdY E2S1 sdY E2AS2
Salvelinus namaycush sdY E2S1 sdY E2AS1
Salmo trutta sdYE1S1 sdY E2AS4
Salmo salar SS sdY S SS sdY AS
Hucho hucho HH sdY S HH sdY AS
Parahuchoperryi sdY E1S1 sdY E2AS4
all salmonid samples 18S S 18S AS
Primers tested for amplification of sdY in Northern pike (Esox lucius)
Species Primer Pair
Esox lucius sdY E2S2 sdY E2AS2
Esox lucius sdY E2S1 sdY E2AS1
Esox lucius sdY E2S1 sdY E2AS3